功能性靶點(diǎn)篩選如何實(shí)現(xiàn)“彎道超車”，基于RNAi的高內(nèi)涵篩選技術(shù)了解一下！
高內(nèi)涵篩選（High-content screening，HCS），又稱高內(nèi)涵分析（high-content analysis，HCA）是指在保持細(xì)胞結(jié)構(gòu)和功能完整性的前提下，同時(shí)檢測被篩樣品對細(xì)胞形態(tài)、生長、分化、遷移、凋亡、代謝途徑及信號轉(zhuǎn)導(dǎo)各個(gè)環(huán)節(jié)的影響, 在單一實(shí)驗(yàn)中獲取大量與基因及其他細(xì)胞成分相關(guān)的信息, 確定其生物活性和潛在毒性的過程。同時(shí), 也是一種應(yīng)用高分辨率的熒光數(shù)碼影像系統(tǒng)，旨在獲得被篩樣品對細(xì)胞產(chǎn)生的多維立體和實(shí)時(shí)快速的生物效應(yīng)信息, 在細(xì)胞水平上檢測多個(gè)指標(biāo)的多元化、功能性篩選技術(shù)平臺。...
miRNA新研究進(jìn)展盤點(diǎn)(20210416)
Nat Rev Mol Cell Biol丨MicroRNA介導(dǎo)的葡萄糖和脂質(zhì)代謝調(diào)節(jié) IF：55.47? Nat Rev Mol Cell Biol...
Theranostics丨RNA測序+siRNA文庫細(xì)胞功能篩選快速鑒定乳腺癌化療耐藥基因及其機(jī)理
紫杉烷類是三陰性乳腺癌（TNBC）患者的一線化療藥物；但是，化學(xué)抗性會(huì)降低其有效性。研究人員假設(shè)新輔助化療（NAC）前后腫瘤標(biāo)本的分子圖譜將有助于鑒定與耐藥相關(guān)的基因。 因此，研究人員通過RNA-seq對來自于8例新輔助化療TNBC患者的10個(gè)樣品進(jìn)行了測序，其中3例病理完全緩解（pCR），5例為非pCR。選擇能夠預(yù)測化療應(yīng)答的差異表達(dá)基因，并通過小規(guī)模siRNA文庫進(jìn)行體外功能篩選。然后，進(jìn)一步在體內(nèi)外研究TNBC相關(guān)基因的臨床和功能意義，并應(yīng)用生化實(shí)驗(yàn)和成像分析來研究其作用機(jī)制。...
高通量基因功能篩選研究利器–siRNA Library
siRNA基因文庫帶來了功能基因組學(xué)研究的效率革命，為功能機(jī)制研究、全新靶點(diǎn)發(fā)現(xiàn)、藥物研發(fā)等提供了一種更高效的途徑，誕生了眾多原創(chuàng)性突破性的研究成果，高內(nèi)涵分析與篩選平臺更是讓siRNA基因文庫的應(yīng)用最大化。 銳博生物采用siCatchTM siRNA優(yōu)化設(shè)計(jì)算法，成功構(gòu)建了genOFF Human Genome siRNA Premix Library、genOFF Human RBP siRNA Premix...
如何發(fā)現(xiàn)lncRNA中m6A新功能，不妨了解下這篇15分paper的研究思路
N6-甲基腺苷（m6A）是哺乳動(dòng)物細(xì)胞中最普遍的mRNA修飾。然而，m6A在特定致癌長鏈非編碼RNAs（ncRNAs）上的疾病相關(guān)功能尚不清楚。為此，天津醫(yī)科大學(xué)第二醫(yī)院牛遠(yuǎn)杰課題組在Molecular Cancer期刊上發(fā)表了題為Long non-coding RNA NEAT1 promotes bone metastasis of prostate cancer through N6-methyladenosine的研究論文。揭示了ncRNA NEAT1-1上的m6A在調(diào)節(jié)Pol II...
MeRIP-Seq助力揭示IGF2BP2促進(jìn)肝癌生長的m6A-FEN1依賴性機(jī)制
肝細(xì)胞癌（HCC）是中國最常見的惡性腫瘤之一。N6-甲基腺苷（m6A）在轉(zhuǎn)錄后基因調(diào)控中起重要作用。METTL3和IGF2BP2是m6A信號通路中的關(guān)鍵基因，最近被證明在癌癥發(fā)展和進(jìn)展中發(fā)揮重要作用。然而，在HCC中，m6A修飾的功能以及m6A甲基轉(zhuǎn)移酶、去甲基化酶和m6A結(jié)合蛋白之間的潛在聯(lián)系仍然不清楚。 ? 為了解決這個(gè)問題，廣西右江民族醫(yī)學(xué)院附屬醫(yī)院韋花媚課題組發(fā)表了題為IGF2BP2 Promotes Liver Cancer Growth Through an m6A-FEN1-Dependent...
Redox Biol (IF9.986)丨m6A閱讀器蛋白YTHDC2通過抑制SLC7A11依賴性抗氧化功能來抑制肺腺癌的發(fā)生
N6-甲基腺苷（m6A）RNA甲基化的生物學(xué)功能主要依賴于閱讀器蛋白；然而，其在肺腫瘤發(fā)生中的作用仍不清楚。近日，上海市胸科醫(yī)院王佳誼課題組在Redox Biology期刊發(fā)表了題為The m6A reader YTHDC2 inhibits lung adenocarcinoma tumorigenesis by suppressing SLC7A11-dependent antioxidant function的研究論文。重點(diǎn)突出了： ? m6A閱讀器蛋白YTHDC2在LUAD中經(jīng)常被抑制，預(yù)示著預(yù)后不良； ?...
收藏丨推薦兩個(gè)非常值得借鑒的m6A研究方案！
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m6A新研究進(jìn)展盤點(diǎn)（20210316）
Nat Commun丨神經(jīng)m6A/Ythdf通路是果蠅學(xué)習(xí)和記憶所必需的 IF：12.121 2021-3-5表觀轉(zhuǎn)錄組修飾可以影響行為。本研究使用果蠅（Drosophila melanogaster）研究mRNA最豐富的修飾N6-甲基腺苷（m6A）。蛋白質(zhì)組學(xué)和功能分析證實(shí)其細(xì)胞核（Ythdc1）和細(xì)胞質(zhì)（Ythdf）YTH結(jié)構(gòu)域蛋白是主要的m6A結(jié)合物。在m6A突變體中進(jìn)行的短期記憶檢測揭示了通過Ythdf，而不是Ythdc1起作用的m6A...
Science子刊丨漿細(xì)胞通過轉(zhuǎn)移外泌體miRNAs來塑造卵巢癌的間充質(zhì)特性
卵巢癌是女性最致命的惡性腫瘤之一，在腫瘤生物學(xué)和臨床預(yù)后中表現(xiàn)出很大的異質(zhì)性。癌細(xì)胞的基因組變化將患者分為不同的亞組，它們具有不同的預(yù)后和對治療的反應(yīng)。由于癌組織是由癌細(xì)胞和非腫瘤細(xì)胞組成，對這些非腫瘤細(xì)胞的功能研究較少。腫瘤免疫學(xué)的成功促使了人們對浸潤性免疫細(xì)胞的研究，以預(yù)測臨床預(yù)后和對治療的反應(yīng)。 ...
