lncRNA新研究進展盤點（20210722）

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IF：17.384? 2021年7月17日

長鏈非編碼RNAs（lncRNAs）是重要的表觀遺傳調控因子，在多種生理和病理過程中發揮著關鍵作用。然而，lncRNAs在肺癌發生中的調控機制尚不明確。本研究通過分析TCGA中肺癌組織的RNA測序（RNA-seq）數據鑒定了一種新型lncRNA LCAT3（肺癌相關轉錄本3），發現其在肺癌組織中顯著上調，并且與預后不良呈正相關。隨后，通過生信分析及MeRIP-seq發現LCAT3上調可歸因于由甲基轉移酶樣蛋白3（METTL3）介導的N6-甲基腺苷（m6A）修飾，導致LCAT3穩定化。功能缺失性分析顯示，LCAT下調在體外顯著抑制肺癌細胞的增殖、遷移和侵襲，在體內異種移植模型中抑制腫瘤的生長和轉移。此外，LCAT3敲低誘導細胞周期阻滯在G1期。機制上，LCAT3與遠端上游元件結合蛋白1（FUBP1）相互作用，導致c-MYC表達的反式激活，從而促進肺癌細胞的增殖、生存、侵襲和轉移。總之，該研究結果表明LCAT3在增強肺癌細胞的惡性表型中發揮了關鍵作用，揭示了LCAT3-FUBP1-cMYC軸的致癌作用，并將其表征為一種十分有前景的預后生物標志物和肺癌的潛在治療靶點。

花青素色素有助于植物著色，并且是人類飲食中作為水果和蔬菜成分的重要抗氧化劑來源。已知它們是由（Malusdomestica）蘋果果實光誘導產生的。然而，負責早期光誘導花青素生物合成的潛在分子機制仍不清楚。本研究鑒定了一種 ERF（乙烯反應因子）蛋白ERF109，它參與光誘導的花青素生物合成，并通過直接結合花青素相關基因啟動子來促進著色。啟動子::GUS（β-葡萄糖醛酸酶）報告基因分析和Hi-C測序表明，位于MdERF109上游的lncRNA MdLNC499誘導MdERF109的表達。MdLNC499啟動子中的W-box順式元件被發現受轉錄因子MdWRKY1的調控。通過在蘋果果實中的瞬時表達和蘋果愈傷組織的穩定轉化，本研究重建了MdWRKY1-MdLNC499-MdERF109轉錄級聯反應，其中MdWRKY1被光激活，從而增加MdLNC499的轉錄，進而誘導MdERF109的轉錄。MdERF109蛋白在蘋果著色的早期誘導花青素相關基因的表達和花青素的積累。本研究結果為更好地理解光誘導的蘋果果實著色所涉及的各種調節機制提供了平臺。

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IF：11.202? 2021年7月20日

p53失活與腫瘤發生和耐藥性高度相關。本研究鑒定了一種長鏈非編碼RNA RMRP（線粒體RNA處理核糖核酸內切酶RNA組分），其作為p53的抑制因子。RMRP在結直腸癌中過表達并與不良預后相關。異位RMRP通過促進MDM2誘導的p53泛素化和降解來抑制p53活性，而RMRP缺失則激活p53通路。RMRP在體外和體內以p53依賴性方式促進結直腸癌的生長和增殖。RMRP的這種抗p53作用是通過一個已確定的伴侶蛋白SNRPA1來實現的。RMRP可以與SNRPA1相互作用并將其隔離在細胞核中，從而通過伴侶蛋白介導的自噬阻斷其溶酶體蛋白水解。然后核SNRPA1與p53相互作用并增強MDM2誘導的p53蛋白酶體降解。值得注意的是，SNRPA1的缺失完全消除了RMRP對p53和腫瘤細胞生長的調節，表明SNRPA1對于RMRP的抗p53功能是必不可少的。有趣且重要的是，PARP抑制劑通過轉錄因子C/EBPβ誘導RMRP表達，并且RMRP通過阻止p53的激活賦予腫瘤對PARP抑制的抗性?？傊?，本研究結果表明RMRP通過SNRPA1使p53在結直腸癌中失活而發揮致癌作用。