7篇IF＞10外泌體miRNA研究高分文章推薦，先收藏，慢慢學習！

Journal of Extracellular Vesicles（IF25.842）丨Exosomes derived from osteogenic tumor activate osteoclast differentiation and

concurrently inhibit osteogenesis by transferring COL1A1-targeting miRNA-92a-1-5p

Science Advances（IF14.131）丨Plasma cells shape the mesenchymal identity of ovarian cancers through transfer of exosome-derived

microRNAs

測序類型：外泌體Small RNA測序

方法流程：

• 取材：3個卵巢癌患者漿細胞外泌體
• 建庫測序：提取外泌體總RNA，制備small RNA文庫并進行miRNA測序（HiSeq 2500）
• 生信分析：miRNA差異顯著性分析、ncRNA分類及注釋、miRNA表達聚類分析、miRNA與疾病關系分析、差異miRNA生存分析、GSEA富集分析等

主要結果：

1. 本研究證明了漿細胞（一種產生抗體的B細胞的子集）在高級別漿液性卵巢癌（HGSCs）的間充質亞型中富集。漿細胞豐度與HGSCs臨床標本中間充質細胞的密度相關。
2. 非間充質卵巢癌細胞與漿細胞共培養在體外和體內誘導了腫瘤細胞的間充質表型。
3. 外泌體Small RNA測序顯示，表型轉換是通過漿細胞來源的含miR-330-3p的外泌體轉移到非間充質卵巢癌細胞中來介導的。外泌體衍生的miR-330-3p以非典型方式增加連接粘附分子B的表達。
4. 硼替佐米對漿細胞的消耗逆轉了卵巢癌的間充質特征并抑制了體內腫瘤生長。

漿細胞外泌體miR-330-3p可轉移至卵巢癌

（Yang Z, et al.?Science advances, 2021.）

Bioactive Materials（IF14.593）丨Chitosan hydrogel incorporated with dental pulp stem cell-derived exosomes alleviates periodontitis

in mice via a macrophage-dependent mechanism

方法流程：

• 取材：牙髓干細胞來源的外泌體（DPSC-Exo）
• 建庫測序：提取DPSC-Exo中的Small RNAs，制備miRNA文庫并進行深度測序（HiSeq 2500）
• 生信分析：Reads分布圖譜分析、已知miRNA表達量計算等

1. 本研究證明了DPSC-Exo摻入的殼聚糖水凝膠（DPSC-Exo/CS）可以加速牙周炎小鼠牙槽骨和牙周上皮的愈合。
2. GO富集分析表明，DPSC-Exo/CS治療可通過抑制牙周炎癥和調節免疫反應來改善牙周病變。
3. 外泌體Small RNA測序顯示，DPSC-Exo/CS促進牙周炎小鼠牙周組織中巨噬細胞從促炎表型向抗炎表型轉化，其機制可能與DPSC-Exo中的miR-1246有關。

DPSC-Exo中的miR-1246促進巨噬細胞從促炎表型轉變為抗炎表型

（Shen Z, et al.?Bioactive materials, 2021.）

Bioactive Materials（IF14.593）丨Bioinspired therapeutic platform based on extracellular vesicles for prevention of arterial wall

remodeling in hypertension

測序類型：細胞外囊泡Small RNA測序

方法流程：

• 取材：3名健康受試者和3名年齡匹配的一期高血壓患者的血漿
• 建庫測序：應用RiboTM EV Isolation Reagent提取血漿中的EV，并分離EV中的RNAs，EV-RNAs用于制備small RNA文庫，隨后進行深度測序（HiSeq 2500，SE50）
• 生信分析：樣品間miRNA差異表達分析、miRNA表達聚類分析、miRNA與疾病關系分析等

主要結果：

1. 本研究發現動脈內皮細胞強烈分泌EV，而EV又可被內皮下平滑肌細胞（SMC）循環和/或直接吸收。
2. 細胞外囊泡Small RNA測序發現，在高血壓下，EV分泌增加，miRNA表達譜發生顯著變化，這主要是由于機械力的增加和隨后活性氧生成的增強。EV所攜帶的miRNA中，miR-320d/423-5p的增加最顯著。
3. 通過工程化EV體內遞送miR-320d/423-5p mimics增加了它們在動脈血管中的表達，重現了高血壓的表型。相比之下，通過工程化EV治療性遞送miR-320d/423-5p inhibitors減輕了自發性高血壓大鼠模型的表型。

高血壓患者EVs中miRNA豐度分析

（Wang C, et al.?Bioactive Materials, 2021.）

Chemical Engineering Journal（IF13.273）丨Three-dimensional mechanical microenvironment enhanced osteogenic activity of

mesenchymal stem cells-derived exosomes

方法流程：

• 取材：從3D張力微環境中分離PDLSC來源的外泌體（SM-Exo）和從無基質張力的3D微環境中分離PDLSC來源的外泌體（Exo）
• 建庫測序：提取外泌體中的總RNA，small RNA用于構建文庫，并進行深度測序（HiSeq 2500）
• 生信分析：樣品間miRNA差異表達分析、miRNA表達聚類分析等

1. 本研究通過磁拉伸膠原水凝膠制備3D張力微環境
2. 外泌體Small RNA測序發現：與Exo組相比，SM-Exo中有25個miRNAs的水平有顯著差異。
3. SM-Exo的生物活性顯著增強，表現在靶細胞（例如BMSCs）的增殖、遷移和成骨分化的改善。
4. 體內研究進一步證實了從3D張力微環境中獲得的PDLSC衍生的外泌體顯示出更強的修復SD大鼠牙槽骨缺損的生物活性。

Theranostics（IF11.553）丨Extracellular vesicles derived from M1 macrophages deliver miR-146a-5p and miR-146b-5p to suppress

trophoblast migration and invasion by targeting TRAF6 in recurrent spontaneous abortion

測序類型：細胞外囊泡Small RNA測序

方法流程：

• 取材：M1-EVs、M1-EVs處理的HTR-8細胞、HTR-8細胞
• 建庫測序：提取總RNA，small RNA用于構建文庫，并進行深度測序（HiSeq 2500）
• 生信分析：樣品間miRNA差異表達分析、miRNA表達聚類分析等

主要結果：

1. M1巨噬細胞通過分泌EV抑制滋養細胞EMT，以降低其體外遷移和侵襲能力。
2. 通過miRNA測序，miR-146a-5p和miR-146b-5p被確定為M1-EVs處理的滋養細胞中上調最多的miRNAs。
3. 功能實驗表明，M1-EVs通過轉移miR-146a-5p和miR-146b-5p抑制滋養細胞遷移和侵襲。
4. 機制上，EV miR-146a-5p和miR-146b-5p通過在轉錄后水平直接抑制TRAF6（TNF 受體相關因子6）表達來抑制滋養細胞的EMT。
5. M1-EVs加劇了小鼠的胚胎吸收。
6. 臨床上，RSA患者胎盤絨毛組織中miR-146a-5p、miR-146b-5p和TRAF6表達異常，miR-146a-5p/miR-146b-5p與TRAF6表達水平呈負相關。

Theranostics（IF11.553）丨Discovery of extracellular vesicles derived miR-181a-5p in patient’s serum as an indicator for bone-

metastatic prostate cancer

測序類型：細胞外囊泡Small RNA測序

方法流程：

• 取材：6例前列腺增生患者（BPH）和13例前列腺癌患者（包括12例非骨轉移性前列腺癌患者，1例骨轉移性前列腺癌患者）血清EVs
• 建庫測序：提取總RNA，構建small RNA文庫，并進行深度測序（HiSeq 2500）
• 生信分析：樣品間miRNA差異表達分析、miRNA表達聚類分析、樣品間主成分分析（PCA）等

主要結果：

1. 通過microRNA深度測序和microRNA芯片陣列，發現4種前瞻性EV遞送的miRNAs，包括miR-181a-5p，其在骨轉移組中的表達顯著高于非骨轉移性前列腺癌組。
2. 在驗證隊列中，logistic回歸分析表明miR-181a-5p與骨轉移性前列腺癌顯著相關。
3. AUC評估確定了miR-181a-5p為最佳生物標志物，用于診斷前列腺癌和骨轉移性前列腺癌的AUCs分別為85.6%和73.8%。