ATF3 -activated accelerating effect of LINC00941/lncIAPF on fibroblast-to-myofibroblast differentiation by blocking autophagy depending on ELAVL1/HuR in pulmonary fibrosis
ATF3激活通過阻斷肺纖維化中依賴于ELAVL1/HuR的自噬促進了LINC00941/lncIAPF對成纖維細胞向肌成纖維細胞分化的作用
發表期刊：Autophagy
影響因子：16.016
發表時間：2022年4月15日
特發性肺纖維化（IPF）以肺部瘢痕為特征，目前尚無有效的治療方法。成纖維細胞向肌成纖維細胞分化、肌成纖維細胞的增殖和遷移是這種疾病的主要臨床表現；因此，阻止這些過程是一種實用的治療策略。本研究發現高度上調的LINC00941/lncIAPF通過促進成纖維細胞向肌成纖維細胞的分化，以及肌成纖維細胞的增殖和遷移來加速肺纖維化。染色質轉座酶可及性測序（ATAC-seq）和染色質免疫沉淀實驗闡明了組蛋白3賴氨酸27乙?；℉3K27ac）激活了LINC00941啟動子上染色體區域的開放。結果，轉錄因子ATF3（激活轉錄因子3）結合到該區域，使LINC00941轉錄增強。RNA親和分離、RNA免疫沉淀（RIP）、RNase-RIP、半衰期分析和泛素化實驗揭示LINC00941與ELAVL1/HuR（ELAV樣RNA結合蛋白1）形成RNA-蛋白復合物以發揮其促纖維化功能。雙熒光mRFP-GFP-MAP1LC3/LC3（微管相關蛋白1輕鏈3）腺病毒監測技術、人自噬RT2分析儀PCR芯片和自噬通量顯示LINC00941-ELAVL1軸抑制自噬體與溶酶體的融合。ELAVL1 RIP-seq、RIP-PCR、mRNA穩定性和挽救實驗表明，LINC00941-ELAVL1復合物通過控制靶基因EZH2（zeste 2多梳抑制復合物2亞基增強子）、STAT1（信號轉導和轉錄激活因子1）和FOXK1（叉頭框K1）的穩定性來抑制自噬。最后，在小鼠模型和IPF患者中證實了LINC00941的治療效果。本研究為IPF提供了一個與自噬相關的治療靶點和新的有效治療策略。
Fig1. lncIAPF作為促纖維化因子促進肺纖維化的機制
原文鏈接：https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35427207/
Long Noncoding RNAs That Function in Nutrition: Lnc-ing Nutritional Cues to Metabolic Pathways
在營養中起作用的長鏈非編碼RNA：Lnc-ing對代謝途徑的營養信號
發表期刊：Annu Rev Nutr
影響因子：11.848
發表時間：2022年4月18日
長鏈非編碼RNAs（lncRNAs）對環境變化敏感，并在健康和疾病中發揮關鍵作用。新的證據表明，lncRNAs通過調節基因表達來形成代謝過程，以響應不斷變化的營養信號。本文回顧了在關鍵代謝組織（肝臟、脂肪和肌肉）中對禁食、喂養和高脂飲食敏感的各種lncRNAs，重點介紹了觸發lncRNAs自身表達變化的調節機制，以及這些lncRNAs如何在特定細胞類型或跨組織中調節關鍵代謝基因的表達。確定lncRNAs如何對營養變化做出反應，對于理解飲食變化后復雜的下游級聯反應至關重要，并且可以決定我們治療代謝疾病的方式。此外，研究可能影響lncRNA調節反應的性別偏見可能會揭示代謝疾病中所觀察到的性別差異的貢獻。
Fig2. 在禁食、再喂食和48h或12周的高脂飲食后，小鼠肝臟、脂肪和肌肉組織中lncRNA表達數量的變化
原文鏈接：https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35436418/
Role of lncSLCO1C1 in gastric cancer progression and resistance to oxaliplatin therapy
lncSLCO1C1在胃癌進展和對奧沙利鉑治療耐藥中的作用
發表期刊：Clin Transl Med
影響因子：11.493
發表時間：2022年4月26日
背景：胃癌（GC）由于腫瘤轉移和對治療的耐藥，是最致命的疾病之一。了解腫瘤進展和耐藥的分子機制將有助于提高治療效果，并開發新的干預策略。
結果：LncSLCO1C1在GC組織樣本中高度上調，并與GC患者較差的總生存期相關。lncSLCO1C1過表達促進了細胞增殖和遷移，而降低lncSLCO1C1表達則產生了相反的效果。lncSLCO1C1還通過減少DNA損傷和增加細胞增殖來介導腫瘤對奧沙利鉑化療的耐藥性。盡管lncSLCO1C1和PDE3A之間存在序列重疊，但PDE3A表達的變化對GC細胞的進展無影響，這表明lncSLCO1C1而不是PDE3A與GC細胞的進展有關。機制上，lncSLCO1C1作為SSRP1（結構特異性識別蛋白1）/H2A/H2B復合物的支架，調節SSRP1在減少DNA損傷方面的功能。同時，lncSLCO1C1可作為分子海綿吸附靶向SSRP1 mRNA的miR-204-5p和miR-211-5p，從而增加SSRP1的表達。lncSLCO1C1和SSRP1均高表達的患者總生存期較差，突顯了lncSLCO1C1在GC進展中的作用。
結論：LncSLCO1C1通過與SSRP1/H2A/H2b復合物相互作用并充當其支架，以及吸附miR-211-5p和miR-204-5p來增加SSRP1表達，從而促進細胞生長和防止DNA損傷，最終促進GC進展。
Fig3. LncSLCO1C1促進腫瘤進展和對奧沙利鉑治療耐藥的作用機制
原文鏈接：https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35474446/
LncRNA-H19 in Fibroblasts Promotes Diabetic Wound Healing
LncRNA-H19在成纖維細胞中促進糖尿病傷口愈合
發表期刊：Diabetes
影響因子：9.461
發表時間：2022年4月26日
糖尿病患者皮膚傷口愈合受損，并會發展為不愈合性潰瘍。然而，傷口愈合過程的分子機制在很大程度上仍不清楚。本研究發現皮膚PDGFRα+成纖維細胞表達的lncRNA-H19（lncH19）通過促進受損皮膚中的真皮成纖維細胞增殖和巨噬細胞浸潤來加速傷口愈合過程。PDGFRα+細胞來源的lncH19在2型糖尿病患者和小鼠的傷口愈合皮膚組織中含量較低，其通過促進真皮成纖維細胞的增殖能力和巨噬細胞募集來促進傷口愈合。機制上，lncH19通過抑制p53活性和GDF15釋放來緩解成纖維細胞的細胞周期停滯，并增加受損組織中的巨噬細胞浸潤。此外，源自脂肪細胞祖細胞的外泌體通過將lncH19遞送至受損組織，有效地恢復受損的糖尿病傷口愈合。因此，本研究揭示了lncRNA在調節皮膚組織修復中的新作用，并為開發糖尿病的臨床治療提供了新的有希望的見解。
Fig4. LncRNA-H19在成纖維細胞中促進糖尿病傷口愈合的機制模型
原文鏈接：https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35472819/
Functional elements of the cis-regulatory lincRNA-p21
順式調控lincRNA-p21的功能元件
發表期刊：Cell Reports
影響因子：9.423
發表時間：2022年4月19日
p53誘導的長鏈非編碼RNA（lncRNA）lincRNA-p21被認為以順式作用促進鄰近細胞周期基因Cdkn1a/p21的p53依賴性表達。轉錄的lincRNA-p21調控位點激活p21表達的分子機制仍然知之甚少。為了闡明順式調節的功能元件，本研究生成了一系列破壞DNA調節元件、lincRNA-p21轉錄或成熟lincRNA-p21積累的遺傳模型。出乎意料的是，研究人員確定了lincRNA-p21的全長轉錄、剪接和積累對于基因座的染色質組織和順式調節是可有可無的。相反，本研究發現通過lincRNA-p21外顯子1中的保守區域產生lincRNA-p21促進了順式激活。這些發現表明，該lncRNA位點新生轉錄的激活（而不是成熟lncRNA轉錄本的產生或積累）是進行局部基因表達控制所必需的。
Fig5. 順式調控lincRNA-p21的功能元件
原文鏈接：https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S2211124722004454
