高通量測序樣品質檢標準及運輸建議
客戶自行提取DNA/RNA的樣品要求符合銳博提取樣品的質檢標準;非特殊情況下,客戶提供質檢信息的樣品,接收后都要再次質檢,確認樣品質量沒有在運輸過程受影響。
1.1 DNA樣品要求
接收樣品前要求客戶分裝備份,用于樣品檢測不合格時分析原因。表3列出了DNA 樣品所需質量標準。
表1. DNA 樣品質量標準
檢測標準說明:
1) 上表中對樣品DNA總量(m)的要求主要針對人、鼠來源的樣品。對于其他來源的樣品,建議以更高的質量要求進行送樣。
2) 濃度、總量,純度參考K5500檢測OD值。
3) 等級A為滿足兩次及兩次以上建庫的樣品標準,等級B為滿足一次建庫的樣品標準。為了保障項目的順利進行,推薦按照等級A標準進行送樣。
4) 如果樣品無法滿足等級A或B中的任何一項指標,同時由于特殊原因無法再準備更多樣品,可根據實際情況進行風險建庫測序,但不保證測序質量。
5) 如有任何問題,請在送樣前咨詢銷售代表或技術支持。
1.2 RNA樣品要求
接收樣品前:要求客戶分裝備份,用于樣品檢測不合格時分析原因。
運輸RNA樣品時:將溶解好的RNA轉至-80℃保存,干冰運輸。
表2列出了RNA樣品所需質量標準。
表2. RNA 樣品質量標準
檢測標準說明:
1) 上表中對樣品RNA總量(m)的要求主要針對人、鼠來源的樣品。對于其他來源的樣品,建議以更高的質量要求進行送樣。
2) 純度參考K5500檢測OD值,濃度參考K5500或Qubit檢測結果。
3) 等級A為滿足兩次及兩次以上建庫的樣品標準,等級B為滿足一次建庫的樣品標準。為了保障項目的順利進行,推薦按照等級A標準進行送樣。
4) 如樣品無法滿足等級A或等級B中的任何一項指標,同時由于特殊原因無法再準備更多樣品,可根據實際情況進行風險建庫測序,但不保證測序質量。
5) 如有任何問題,請在送樣前咨詢銷售代表或技術支持。
6) MeRIP實驗獲得的RNA進行后續建庫測序均為風險建庫。
1.3?自建庫樣品準備建議
表3. 客戶自建庫建議樣品質量標準
注:
1) 如客戶使用試劑盒進行文庫構建,需提供試劑盒的詳細信息(最好提供一份建庫時所使用的核酸序列的電子文檔供參考),以及每個文庫的index編號和序列;
2) 如客戶不是使用商品化試劑盒進行文庫構建,需要提供建庫流程的詳細信息(尤其是adapter和PCR primer序列),以及每個文庫的index編號和序列。

