Transcriptome and chromatin alterations in social fear indicate association of MEG3 with successful extinction of fear
社交恐懼中的轉錄組和染色質改變表明MEG3與成功消除恐懼有關
發表期刊：Mol Psychiatry
影響因子：15.992
發表時間：2022年3月25日
社交焦慮障礙的特征是對社交場合的持續恐懼和回避，但可用的治療方案相當不明確。使用已建立的小鼠社交恐懼條件反射（SFC）范例，研究人員分析了社交恐懼獲得和消失后隔膜內（隔膜是對社交恐懼和社交行為很重要的大腦區域）的基因表達和染色質改變。本研究特別關注社交恐懼消除訓練的成功與不成功結果，這對應于臨床中對治療有反應的患者與耐藥的患者。編碼和非編碼RNAs的驗證揭示了長鏈非編碼RNA (lncRNA) Meg3的特定亞型受到調節，這取決于社交恐懼的成功消除。此外，PI3K/AKT在SFC小鼠中被差異激活并成功消除。體內敲低特定Meg3亞型增加了PI3K/AKT信號的基線活性，并輕微延遲了社交恐懼的消除。使用ATAC-Seq和CUT&RUN，研究人員發現特定基因的染色質結構發生了改變，這可能是lncRNA Meg3的直接靶標。
Fig1. Meg3-ex10功能缺失導致社交恐懼消除延遲
原文鏈接：https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35338311/
Long noncoding RNA NEAT1 promotes ferroptosis by modulating the miR-362-3p/MIOX axis as a ceRNA
長鏈非編碼RNA NEAT1通過調節miR-362-3p/MIOX軸作為ceRNA促進鐵死亡
發表期刊：Cell Death Differ
影響因子：15.828
發表時間：2022年3月25日
鐵死亡是一種由鐵依賴性脂質過氧化誘導的新型調節性細胞死亡，在腫瘤的發展和耐藥性中起重要作用。據報道，lncRNA NEAT1參與調節腫瘤細胞周期、增殖、凋亡和遷移。然而，NEAT1在調節腫瘤鐵死亡中的功能和分子機制仍不清楚。本研究發現鐵死亡誘導劑erastin和RSL3通過促進p53與NEAT1啟動子的結合來增加NEAT1的表達。誘導NEAT1通過競爭性結合miR-362-3p促進MIOX的表達。MIOX增加了ROS的產生并降低了細胞內NADPH和GSH的水平，從而導致erastin和RSL3誘導的鐵死亡增強。重要的是，在體外和體內，NEAT1的過表達通過增強鐵死亡增加了erastin和RSL3的抗腫瘤活性。總的來說，這些數據表明NEAT1通過調節miR-362-3p和MIOX在鐵死亡中發揮著新的、不可或缺的作用。考慮到HCC患者對化療和免疫治療不敏感的臨床發現，對于NEAT1高表達的HCC患者，鐵死亡誘導可能是一種有前景的治療策略。
Fig2. NEAT1/miR-362-3p/MIOX軸調控HCC細胞鐵死亡示意圖
原文鏈接：https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35338333/
WTAP-mediated m6A modification of lncRNA NORAD promotes intervertebral disc degeneration
WTAP介導的lncRNA NORAD m6A修飾促進椎間盤退行性變
發表期刊：Nat Commun
影響因子：14.913
發表時間：2022年3月18日
N6-甲基腺苷（m6A）是轉錄后水平上最普遍的RNA修飾，涉及各種疾病和細胞過程。然而，m6A調節椎間盤退行性變（IVDD）的潛在機制仍然不清楚。本研究通過m6A測序發現，lncRNA NORAD的甲基化在衰老的髓核細胞（NPCs）中顯著增加。隨后的功能缺失和獲得性實驗表明，由于KDM5a介導的啟動子H3K4me3的表觀遺傳增加，WTAP在衰老的NPCs中增加，并顯著促進了NORAD m6A修飾。此外，YTHDF2介導的NORAD衰變在衰老的NPCs中增強，然后NORAD的缺失導致PUMILIO蛋白的螯合減少，這有助于增強PUM1/2的活性，從而抑制靶E2F3 mRNA的表達并促進細胞衰老。本研究結果表明了中斷NORAD m6A修飾或NORAD/PUMILIO/E2F3軸可以作為抑制NPCs衰老和IVDD發展的潛在治療靶點。
Fig3. m6A修飾介導NPC衰老和IVDD進展的機制示意圖
原文鏈接：https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35304463/
WDR82-binding long noncoding RNA lncEry controls mouse erythroid differentiation and maturation
WDR82結合的長鏈非編碼RNA lncEry控制小鼠紅系分化和成熟
發表期刊：J Exp Med
影響因子：14.307
發表時間：2022年3月22日
造血分化受遺傳和表觀遺傳調節因子的控制。長鏈非編碼RNAs（lncRNAs）已被證明在正常造血過程中發揮重要作用，但它們在紅細胞生成中的功能仍有待進一步探索。本研究通過深度RNA測序分析了16個小鼠造血細胞群的轉錄組，并鑒定了一種新型lncRNA Gm15915，其在紅細胞相關的祖細胞和紅細胞中高度表達。因此，將其命名為lncEry。研究人員還鑒定了一種新的 lncEry亞型，這是以前沒有報道過的主要轉錄本。lncEry缺失導致紅細胞生成受損，表明lncRNA在調節紅細胞分化和成熟中發揮重要作用。機制上，lncEry與WDR82（WD重復蛋白82）相互作用以促進Klf1和珠蛋白基因的轉錄，從而分別控制紅細胞生成的早期和晚期階段。這些發現將lncEry確定為紅細胞生成轉錄調控的重要參與者。
Fig4. lncEry與Wdr82結合參與紅細胞生成調控的機制模型
原文鏈接：https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35315911/
LncRNA GACAT2 binds with protein PKM1/2 to regulate cell mitochondrial function and cementogenesis in an inflammatory environment
LncRNA GACAT2與蛋白PKM1/2結合以調節炎癥環境中的細胞線粒體功能和牙骨質發生
發表期刊：Bone Res
影響因子：13.567
發表時間：2022年3月16日
牙周膜干細胞（PDLSCs）是修復/再生丟失/受損牙周組織的關鍵細胞類型，包括牙槽骨、牙周膜和牙根牙骨質，后者對于恢復牙齒功能至關重要。然而，存在于炎癥環境中的PDLSCs通常表現出受損的功能，正如其分化為負責牙骨質再生的成牙骨質細胞的能力受損所證明的那樣。本研究探討了線粒體功能和下游長鏈非編碼RNAs（lncRNAs）在調節炎癥誘導的PDLSCs牙骨質發生變化中的作用。研究發現炎癥細胞因子誘導的PDLSCs牙骨質發生的損傷與其線粒體功能密切相關，lncRNA微陣列分析和功能獲得/缺失性研究確定GACAT2是作為參與炎癥介導的線粒體功能和牙骨質發生的細胞事件的調節因子。隨后，通過質譜（ChIRP-MS）和平行反應監測（PRM）分析對RNA結合蛋白進行了全面鑒定，結果表明GACAT2可以直接結合與線粒體功能相關的蛋白質PKM1/2（丙酮酸激酶M1/2）。進一步的功能研究表明，GACAT2過表達增加了PKM1/2、PKM2四聚體和磷酸化PKM2的細胞蛋白表達，這導致丙酮酸激酶（PK）活性增強并增加了PKM2向線粒體的易位。然后研究人員發現GACAT2過表達可以逆轉炎癥誘導的PDLSCs對線粒體功能和成牙骨質細胞分化的損害，并且這種效應可以通過PKM1/2敲低來消除。本研究數據表明，lncRNA GACAT2通過與PKM1/2蛋白結合，在炎癥環境中調節線粒體功能和牙骨質發生中發揮了關鍵作用。
Fig5. 炎癥環境下，lncRNA GACAT2在調節PDLSCs的線粒體功能和成牙骨質細胞分化中起核心作用
原文鏈接：https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35296649/
