Promoter and enhancer RNAs regulate chromatin reorganization and activation of miR-10b/HOXD locus, and neoplastic transformation in glioma
啟動子和增強子RNAs調節染色質重組和miR-10b/HOXD位點的激活，以及膠質瘤的腫瘤轉化
發表期刊：Mol Cell
影響因子：17.970
發表時間：2022年3月29日
miR-10b在大腦的正常神經膠質細胞中一般保持沉默，但在膠質瘤中通常被激活，它在其中發揮重要的腫瘤促進作用。本研究證明了整個承載miR-10b的HOXD位點通過涉及3D染色質重組和CTCF-cohesin介導的成環的順式作用機制在神經膠質瘤中被激活。這種機制需要兩個相互作用的lncRNAs，HOXD-AS2和LINC01116，一個與HOXD3/HOXD4/miR-10b啟動子相關，另一個與遠程增強子相關。在神經膠質瘤細胞中敲低任何一個lncRNA都會改變CTCF和cohesin的結合，破壞染色質成環，抑制HOXD位點內所有基因的表達，并導致神經膠質瘤細胞死亡。相反，在皮質星形膠質細胞中，增強子激活足以進行HOXD/miR-10b位點重組、基因去抑制和腫瘤細胞轉化。LINC01116 RNA對于這一過程至關重要。本研究結果證明了兩個lncRNAs在染色質折疊中的相互作用，以及協同調控miR-10b和多個HOXD基因在星形膠質細胞中的正常沉默，并觸發腫瘤性膠質細胞轉化。
Fig1. 膠質母細胞瘤中HOXD/miR-10b基因去抑制的機制模型
原文鏈接：https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35390275/
LINC01431 Promotes Histone H4R3 Methylation to Impede HBV Covalently Closed Circular DNA Transcription by Stabilizing PRMT1
LINC01431通過穩定PRMT1促進組蛋白H4R3甲基化以阻止HBV共價閉合環狀DNA轉錄
發表期刊：Adv Sci (Weinh)
影響因子：16.806
發表時間：2022年4月10日
共價閉合環狀DNA（cccDNA）是乙型肝炎病毒（HBV）的轉錄模板，它與宿主和病毒蛋白相互作用，在細胞核中形成微染色體，并對抗病毒藥物具有抗性。鑒定參與cccDNA轉錄調控的宿主因子有望為HBV治療提供一個新的途徑。最近的證據表明，長鏈非編碼RNAs（lncRNAs）參與介導宿主因子與各種病毒的相互作用。然而，HBV靶向并抑制cccDNA轉錄的lncRNAs尚未完全闡明。本研究將LINC01431鑒定為一種新型HBV轉錄宿主限制因子。機制上，LINC01431與PRMT1（I型蛋白精氨酸甲基轉移酶）競爭性結合，以阻斷HBx介導的PRMT1泛素化和降解。因此，LINC01431增加了PRMT1在cccDNA上的占有率，導致H4R3me2a修飾增強和cccDNA結合組蛋白的乙?；瘻p少，從而抑制cccDNA轉錄。反過來，為了促進病毒復制，HBV通過HBx介導的轉錄因子ZHX2（鋅指和同源框2）的抑制來轉錄抑制LINC01431的表達?？偟膩碚f，該研究證明LINC01431是cccDNA微型染色體的一種新型表觀遺傳調節因子，并突出了HBx-LINC01431-PRMT1在HBV復制中的反饋回路，這為HBV治療提供了潛在的治療靶點。
Fig2. LINC01431和PRMT1相互作用抑制HBV cccDNA轉錄的模型示意圖
原文鏈接：https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35398991/
Hypoxia-induced HIF-1α/lncRNA-PMAN inhibits ferroptosis by promoting the cytoplasmic translocation of ELAVL1 in peritoneal dissemination from gastric cancer
缺氧誘導的HIF-1α/lncRNA-PMAN通過促進ELAVL1在胃癌腹膜播散中的胞質易位來抑制鐵死亡
發表期刊：Redox Biology
影響因子：11.799
發表時間：2022年4月9日
腹膜轉移（PM）是胃癌（GC）遠處轉移的主要部位，預后和生存率極差。缺氧是腹膜轉移的共同特征，HIF-1α（缺氧誘導因子1α）的上調可能是PM發生的潛在驅動因素。鐵死亡是最近發現的一種受調控的細胞死亡形式，與腫瘤的發生和發展密切相關。然而，將HIF-1α與GC PM中的鐵死亡聯系起來的潛在機制仍然未知。本研究通過lncRNA微陣列和RNA文庫構建/lncRNA-seq分析發現，lncRNA-PMAN在PM中高表達，并受到HIF-1α的顯著調節。 PMAN的上調與GC患者的不良預后和PM相關。PMAN被HIF-1α上調并通過促進ELAVL1的細胞質分布來提高SLC7A11 mRNA的穩定性，這在RNA-pulldown/質譜結果中得到了鑒定。SLC7A11的積累會增加l-谷胱甘肽（GSH）的水平并抑制GC細胞中活性氧（ROS）和鐵的積累。最后保護GC細胞免受Erastin和RSL3誘導的鐵死亡。本研究結果闡明了HIF-1α/PMAN/ELAVL1在GC細胞鐵死亡中的作用，并為GC中PM的潛在診斷生物標志物和治療靶點提供了理論支持。
Fig3. 缺氧時PMAN通過SLC7A11調節鐵死亡的模型示意圖
原文鏈接：https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S2213231722000842
LncRNA PCAT1 activates SOX2 and suppresses radioimmune responses via regulating cGAS/STING signalling in non-small cell lung cancer
LncRNA PCAT1通過調節非小細胞肺癌中的cGAS/STING信號激活SOX2并抑制放射免疫反應
發表期刊：Clin Transl Med
影響因子：11.492
發表時間：2022年4月12日
背景：長鏈非編碼RNA（lncRNA）PCAT1（前列腺癌相關ncRNA轉錄本1）在非小細胞肺癌（NSCLC）中的表達增加。它刺激腫瘤生長和轉移，但其在放射免疫反應中的作用仍然未知。 本研究旨在探討PCAT1對NSCLC腫瘤發生和放射免疫反應的影響以及潛在的分子機制。
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結果：PCAT1具有免疫抑制作用，與NSCLC的侵襲有關。PCAT1增加與NSCLC中的免疫細胞浸潤呈負相關。PCAT1敲低在體內和體外抑制增殖、增加細胞凋亡和抑制細胞轉移。PCAT1激活SOX2，加速腫瘤發生和免疫抑制。SOX2通過抑制細胞毒性T細胞免疫促進腫瘤生長。此外，SOX2抑制cGAS轉錄并阻礙下游I型干擾素(IFN)誘導的免疫應答。抑制PCAT1/SOX2協同放療可進一步抑制腫瘤生長，并啟動cGAS/STING信號通路，從而增強NSCLC放療的免疫應答。
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結論：PCAT1/SOX2軸通過抑制cGAS/STING信號介導的T細胞活化促進腫瘤發生和免疫抑制。抑制PCAT1和SOX2與放療協同激活免疫反應，可作為潛在的治療靶點。
Fig4. PCAT1通過調節NSCLC中的cGAS/STING信號以激活SOX2并抑制放射免疫反應的潛在機制示意圖
原文鏈接：https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35415876/
LncRNA PMAT-PtoMYB46 module represses PtoMATE and PtoARF2 promoting Pb2+ uptake and plant growth in poplar
LncRNA PMAT-PtoMYB46組件抑制PtoMATE和PtoARF2以促進楊樹中Pb2+的吸收和植物生長
發表期刊：J Hazard Mater
影響因子：10.588
發表時間：2022年3月23日
鉛（Pb2+）是最具毒性的重金屬污染物之一。具有大量生物量的速生型木本植物是生物修復的理想選擇。然而，木本植物中Pb2+攝取的轉錄調控仍然不清楚。本研究在毛白楊（Populus tomentosa）中鑒定了226個Pb2+誘導的、差異表達的長鏈非編碼RNAs（DELs）。功能注釋顯示，這些DELs主要通過其潛在的靶基因調節碳代謝、次生代謝物的生物合成、能量代謝和信號轉導。關聯和上位性分析表明，lncRNA PMAT（Pb2+誘導的MATE（多藥和有毒化合物擠壓）反義lncRNA）與PtoMYB46上位相互作用以調節葉片干重、光合作用速率和轉酮酶活性。遺傳轉化和分子檢測表明，PtoMYB46通過PMAT直接或間接降低PtoMATE的表達，從而減少檸檬酸（CA）的分泌，最終促進Pb2+的攝取。同時，PtoMYB46靶向ARF2（生長素應答因子2）并降低其表達，從而正向調節植物生長。本研究結果表明PMAT-PtoMYB46-PtoMATE-PtoARF2調節模塊控制Pb2+耐受性、吸收和植物生長。這項研究證明了lncRNAs參與響應楊樹中的Pb2+，為開發用于植物修復鉛污染土壤的遺傳改良木本植物品種的潛力提供了新的見解。
Fig5. Pb2+處理下毛白楊中涉及PMAT、PtoMYB46、PtoMATE和PtoARF2的Pb2+攝取和植物生長調控網絡模型
原文鏈接：https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35364535/
