Long noncoding RNA TLNC1 promotes the growth and metastasis of liver cancer via inhibition of p53 signaling
長鏈非編碼RNA TLNC1通過抑制p53信號促進肝癌的生長和轉移
發表期刊：Mol Cancer
影響因子：27.401
發表時間：2022年4月27日
背景：長鏈非編碼RNAs（lncRNAs）已被證明在癌癥發展和進展中發揮重要作用。然而，它們在肝癌中的生物學作用和功能機制在很大程度上仍然未知。
結果：基于RNA-seq、TCGA RNA-seq和TCGA生存分析數據的交集，本研究將TLNC1鑒定為肝癌的潛在致瘤lncRNA。TLNC1在體內外均顯著促進肝癌細胞的生長和轉移。TLNC1發揮其致瘤作用是通過與TPR相互作用并誘導TPR介導的p53從細胞核到細胞質的轉運，從而抑制p53靶基因的轉錄，最終促進肝癌的進展。
結論：TLNC1是一種很有前景的肝癌預后因子，TLNC1-TPR-p53軸可作為肝癌治療的潛在治療靶點。
Fig1. TLNC1在調節p53信號通路中的功能示意圖
原文鏈接：https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35477447/
Urinary extracellular vesicles contain mature transcriptome enriched in circular and long noncoding RNAs with functional significance in prostate cancer
尿細胞外囊泡包含成熟的轉錄組，富含在前列腺癌中具有重要功能意義的環狀和長鏈非編碼RNAs
發表期刊：J Extracell Vesicles
影響因子：25.841
發表時間：2022年5月8日
長鏈非編碼（lnc）RNAs調節基因表達，同時呈現出意想不到的新抗原來源。盡管他們有巨大的利益，但他們轉移和控制相鄰細胞的能力尚不清楚。細胞外囊泡（EVs）為核酸提供保護環境，通過控制免疫反應具有促腫瘤和抗腫瘤功能。與細胞外非囊泡RNA相比，很少有研究涉及人類體液EVs中的全部RNA內含物，并將其與它們的起源組織進行比較。本研究對6個福爾馬林固定石蠟包埋（FFPE）前列腺癌（PCa）腫瘤組織及其配對的尿液（u）EVs進行了總RNA測序，以提供來自同一患者的第一個全轉錄組比較。UEVs包含有無內含子的細胞質轉錄本和豐富的lnc/環狀（circ）RNAs的簡化轉錄組，這在獨立的20例患者的泌尿隊列中非常常見。研究人員對三個PCa細胞系中的完整細胞和EVs轉錄組進行了比較，鑒定了一組重疊的14個uEV-circRNAs，這些uEV-circRNAs被表征為體外前列腺細胞增殖所必需的，以及屬于CLC2（Cancer-related LncRNA Census）的28個uEV-lncRNAs。此外，本研究發現了15個uEV-lncRNAs，預測編碼768種高親和力新抗原，通過質譜分析發現其中3個編碼的ORF產生了可檢測到的未修飾多肽。本研究對尿液和體外EVs中EVs-lnc/circRNAs的雙重分析為未來涉及PCa的uEV-lnc/circRNAs表型表征提供了基礎資源。
Fig2. uEVs富集的RNAs顯示lncRNA編碼的新抗原被前列腺細胞系共享
原文鏈接：https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35527349/
LncRNA-PACERR induces pro-tumour macrophages via interacting with miR-671-3p and m6A-reader IGF2BP2 in pancreatic ductal adenocarcinoma
LncRNA-PACERR通過與miR-671-3p和m6A-reader IGF2BP2相互作用誘導胰腺導管腺癌中的促腫瘤巨噬細胞
發表期刊：J Hematol Oncol
影響因子：17.388
發表時間：2022年5月7日
背景：LncRNA-PACERR在組織相關巨噬細胞（TAMs）的極化中起著關鍵作用。在本研究中，研究人員發現了PACERR在TAMs中調節胰腺導管腺癌（PDAC）進展的功能和分子機制。
結果：LncRNA-PACERR在TAMs中高表達，與PDAC患者的不良預后相關。本研究發現驗證了LncRNA-PACERR增加了M2極化細胞的數量，并在體外和體內促進了細胞的增殖、侵襲和遷移。機制上，LncRNA-PACERR通過與miR-671-3p結合激活KLF12/p-AKT/c-myc通路。而與IGF2BP2結合的LncRNA-PACERR以m6A依賴性方式增強了KLF12和c-myc在細胞質中的穩定性。此外，LncRNA-PACERR的啟動子是KLF12的靶標，LncRNA-PACERR通過在細胞核中與KLF12相互作用，募集EP300以增加組蛋白的乙酰化。
結論：本研究發現LncRNA-PACERR作為PDAC微環境中TAMs的關鍵調節因子，揭示了細胞質和細胞核中的新機制。
Fig3. 模型圖展示了TAMs中LncRNA-PACERR和KLF12之間的正反饋回路，以促進PDAC中的增殖和遷移
原文鏈接：https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35526050/
Enhancer RNAs stimulate Pol II pause release by harnessing multivalent interactions to NELF
增強子RNAs通過利用與NELF的多價相互作用來刺激Pol II暫停釋放
發表期刊：Nat Commun
影響因子：14.919
發表時間：2022年5月4日
增強子RNAs（eRNAs）是源自增強子的長鏈非編碼RNAs。盡管eRNA轉錄是激活增強子的典型特征，但eRNA功能所需的分子特征以及eRNAs如何影響靶基因轉錄的機制尚未確定。因此，本研究使用eRNA依賴性RNA聚合酶II（Pol II）暫停釋放作為模型，研究了eRNAs的序列、結構和長度對它們通過從暫停的Pol II中分離NELF來刺激Pol II暫停釋放能力的要求。研究發現eRNA并非通過常見的結構或序列基序發揮其功能。相反，長度大于200個核苷酸且包含未配對鳥苷的eRNAs與NELF亞基-A和-E進行多次變構接觸，以觸發有效的NELF釋放。通過揭示eRNA功能的分子決定因素，本研究證實了eRNAs在Pol II暫停釋放中發揮了重要作用，并為研究后生動物轉錄的調控提供了新的見解。
Fig4. eRNA和暫停延伸復合物（PEC）之間的多價變構相互作用刺激Pol II暫停釋放模型示意圖
原文鏈接：https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35508485/
Copy number amplification and SP1-activated lncRNA MELTF-AS1 regulates tumorigenesis by driving phase separation of YBX1 to activate ANXA8 in non-small cell lung cancer
拷貝數擴增和SP1激活的lncRNA MELTF-AS1通過驅動YBX1的相分離激活非小細胞肺癌中的ANXA8來調節腫瘤發生
發表期刊：Oncogene
影響因子：9.867
發表時間：2022年5月4日
據報道，長鏈非編碼RNAs（lncRNAs）在腫瘤發生中起著關鍵作用。然而，lncRNA介導的RNA結合蛋白相分離在腫瘤發生中的調控機制尚未完全闡明。本研究通過系統的數據分析、篩選和驗證，鑒定出一個致癌lncRNA MELTF-AS1。MELTF-AS1在非小細胞肺癌（NSCLC）中顯著上調。高MELTF-AS1水平與晚期腫瘤-淋巴結轉移期（TNM）、高腫瘤大小和生存時間縮短相關。功能上，MELTF-AS1在體外和體內調節細胞增殖和轉移。RNA測序分析顯示，MELTF-AS1敲低特異性調節了與細胞增殖、凋亡和遷移相關的基因。機制研究發現，在基因組水平上，拷貝數擴增促進了MELTF-AS1的表達。在轉錄水平上，轉錄因子SP1通過與其啟動子結合直接激活MELTF-AS1的轉錄。此外，MELTF-AS1可以直接結合并驅動YBX1（YBX1是一種RNA結合蛋白，參與腫瘤發生）的相分離，從而激活ANXA8轉錄，促進NSCLC的腫瘤發生。已在多種腫瘤中發現了ANXA8的異常激活和促進腫瘤發生。這些新發現證明了MELTF-AS1驅動的相分離介導的轉錄調控的關鍵作用，并為NSCLC提供了一個潛在的新型診斷和治療靶點。
Fig5. MELTF-AS1介導的NSCLC增殖和轉移模型
原文鏈接：https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35508543/
