Substoichiometric action of long noncoding RNAs
長鏈非編碼RNAs的亞化學計量作用
發表期刊：Nat Cell Biol
影響因子：28.824
發表時間：2022年5月13日
長鏈非編碼RNAs（lncRNAs）的低表達水平和化學計量失衡通常被用作其可能缺乏功能或限制其潛在影響范圍的證據。我們對lncRNAs亞化學計量作用理解的研究進展挑戰了這些概念，并提出了不豐富的lncRNAs影響細胞功能和基因調控網絡的途徑。
Fig1. lncRNAs Cyrano和SLERT被循環利用以修改靶標的超化學計量數
原文鏈接：https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35562482/
Ezh2 competes with p53 to license lncRNA Neat1 transcription for inflammasome activation
Ezh2與p53競爭使lncRNA Neat1轉錄以激活炎癥小體
發表期刊：Cell Death Differ
影響因子：15.828
發表時間：2022年5月14日
炎癥小體有助于各種炎性疾病的發病機制，但控制其激活的表觀遺傳機制仍然不明確。本研究發現組蛋白甲基轉移酶Ezh2介導了巨噬細胞/小膠質細胞中多種類型炎癥小體的激活，而不依賴其甲基轉移酶活性，從而促進了炎癥小體相關的病理。機制上，Ezh2通過其SANT2結構域來維持長鏈非編碼RNA（lncRNA）Neat1啟動子區域中H3K27乙?；母患?，從而促進染色質的可及性并促進p65介導的Neat1（炎癥小體組裝和激活的關鍵中介因子）轉錄。此外，腫瘤抑制蛋白p53與Ezh2競爭Neat1啟動子中的相同結合區域，從而拮抗Ezh2誘導的Neat1轉錄和炎癥小體的激活。因此，Ezh2的缺失強烈促進了p53的結合，從而募集去乙?；窼IRT1用于Neat1啟動子的H3K27去乙酰化，從而抑制Neat1轉錄和炎癥小體的激活?？傮w而言，本研究證明了一種通過Ezh2/p53競爭模型調節炎癥小體激活的表觀遺傳機制，并強調了Ezh2在維持H3K27乙?；灾С謑ncRNA Neat1轉錄的新功能。
Fig2. Ezh2-p53競爭調節炎癥小體的激活
原文鏈接：https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35568718/
The long noncoding RNA Malat1 regulates CD8+ T cell differentiation by mediating epigenetic repression
長鏈非編碼RNA Malat1通過介導表觀遺傳抑制調節CD8+ T細胞分化
發表期刊：J Exp Med
影響因子：14.307
發表時間：2022年5月20日
在對微生物感染的免疫反應過程中，CD8+ T細胞會產生短暫的效應細胞和記憶細胞，從而提供持續的保護。盡管調節CD8+ T細胞分化的轉錄程序已被廣泛表征，但長鏈非編碼RNAs（lncRNAs）在此過程中的作用仍知之甚少。使用功能性基因敲除篩選，本研究將lncRNA Malat1鑒定為終末效應細胞和終末效應記憶（t-TEM）循環記憶亞群的調節因子。對富含染色質的lncRNAs的評估表明，Malat1與反式lncRNAs聚集在一起，在基因啟動子和基因體處表現出RNA相互作用的增加。此外，研究人員觀察到Malat1通過與Ezh2的直接相互作用，與許多記憶細胞相關基因的H3K27me3沉積增加有關，從而促進終末效應子和t-TEM細胞分化。本研究結果表明Malat1在調節CD8+ T細胞分化中具有重要的功能作用，并拓寬了CD8+ T細胞生物學中lncRNAs的知識基礎。
Fig3. 體內shRNA篩選顯示lncRNA Malat1是CD8+ T細胞分化的關鍵調節因子
原文鏈接：https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35593887/
TP53-inducible putative long noncoding RNAs encode functional polypeptides that suppress cell proliferation
TP53誘導的假定長鏈非編碼RNAs編碼抑制細胞增殖的功能性多肽
發表期刊：Genome Res
影響因子：9.043
發表時間：2022年5月24日
由長鏈非編碼RNAs（lncRNAs）編碼的多肽是一類新型的功能分子。然而，這些隱藏的多肽是否參與TP53通路并發揮重要的生物學作用仍不清楚。本研究發現TP53調節的lncRNAs編碼多肽，其中兩種在不同的人類細胞系中發揮作用。使用核糖體分析和RNA-seq方法，研究人員在HepG2細胞中系統地鑒定了300多個新的TP53調節的lncRNAs，并進一步證實了其中15個TP53調節的lncRNAs編碼多肽。此外，研究人員通過多種質譜測量驗證了幾種多肽。 10個新型翻譯lncRNAs可直接被TP53誘導以響應DNA損傷。值得注意的是，本研究發現TP53誘導肽TP53LC02和TP53LC04，而不是它們的lncRNAs，可以抑制細胞增殖。TP53LC04肽還通過調節細胞周期以響應DNA損傷而具有與細胞增殖相關的功能。本研究表明，TP53誘導的lncRNA編碼新的功能性多肽，從而擴大了TP53腫瘤抑制網絡的組成部分，并為癌癥治療提供了新的潛在靶點。
Fig4. 研究模型示意圖
原文鏈接：https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35609991/
The lncRNA PILA promotes NF-κB signaling in osteoarthritis by stimulating the activity of the protein arginine methyltransferase PRMT1
lncRNA PILA通過刺激蛋白質精氨酸甲基轉移酶PRMT1的活性促進骨關節炎中的NF-κB信號
發表期刊：Science Signaling
影響因子：8.192
發表時間：2022年5月24日
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炎癥細胞因子誘導的核因子κB（NF-κB）信號的激活在骨關節炎（OA）的發病機制中起著關鍵作用。本研究將PILA鑒定為一種可以增強NF-κB信號和OA的長鏈非編碼RNA（lncRNA）。PILA的豐度在OA患者受損的軟骨中以及在促炎細胞因子腫瘤壞死因子（TNF）刺激的人關節軟骨細胞中增加。PILA的敲低抑制了TNF誘導的NF-κB信號、細胞外基質分解代謝和軟骨細胞凋亡，而PILA的異位表達促進了NF-κB信號和基質降解。PILA促進PRMT1介導的DExH-box解旋酶9（DHX9）的精氨酸甲基化，導致編碼轉化生長因子β活化激酶1（TAK1）的基因轉錄增加，TAK1是NF-κB信號的上游激活因子。此外，關節內注射編碼PILA的腺病毒載體會引發自發性軟骨損失，并加劇小鼠的創傷后OA。本研究為探索NF-κB信號在OA中的調控提供了新的思路，并鑒定了該疾病的一個潛在治療靶點。
Fig5. lncRNA PILA在骨關節炎中促進NF-κB信號的作用模型
原文鏈接：https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35609127/
