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產品簡介

Bulge-LoopTM ?miRNA qRT-PCR是銳博生物自主研發的miRNA成熟鏈檢測方法,該方法基于特異性的莖環狀RT引物及正反向引物,并采用SYBR Green染料檢測,無需熒光探針,具有高靈敏度和高特異性的優點。Bulge-LoopTM miRNA qRT-PCR Starter Kit包括該檢測方法所需要的RT酶,qPCR酶,客戶僅需配合相應的Bulge-LoopTM miRNA Primer set及內參(如U6,5S)即可進行高效檢測。

Reagent?(In tube) C10211-1 (20T RT + 60T qPCR) C10211-2?(100T RT + 300T qPCR) C10211-3?(500T RT + 1500T qPCR)
RTase Mix 40 μL 200 ?μL 1 ml
5X Reverse Transcription Buffer 40 μL 200 μL 1 ml
2X SYBR Green Mix 600 μL 1 ml X 3 1 ml X 15

運輸保存

 

產品需低溫運輸。收到產品后,請于-20℃保存,可以穩定保存一年。

使用前請瞬時離心。

 

 

實驗方法

 

miRNA RT反應

1)取Bulge-LoopTM ?miRNA RT Primer (20 μM),加入適量RNase-free H2O,配置成Bulge-LoopTM ?miRNA RT Primer (5 μM)。

2)推薦以10 μl RT反應體系進行實驗:

Reagent 10 μL?體系 終濃度
RNA Template (1 μg) x μL ?
Bulge-LoopTM miRNA RT Primer (5 μM) 1 μL 500 nM
5X Reverse Transcription Buffer 2 μL 1X
RTase Mix 2 μL ?
RNase-free H2O 至10 μL ?

以上體系混勻后,瞬時離心,RT反應程序為:42℃ 60 min,70℃ 10 min。

 

注:

1)最佳RT引物濃度依據具體實驗而定,引物濃度范圍可在200nM~800nM之間優化;

2)RT反應結束后請立即將cDNA產物取出,快速置于冰上冷卻;

3)內參引物(U6,5S等)的使用與miRNA的檢測方法一致。

 

miRNA qPCR反應

 

1)SYBR Green Mix:包括Taq酶、dNTP mix、PCR Buffer、SYBR GreenⅠ等。

推薦以20 μl qPCR反應體系進行實驗:

Reagent 20 μl 體系 終濃度
2X SYBR Green Mix 10 μl 1X
RT Product 2 μl ?
Bulge-LoopTM miRNA Forward Primer (5 μM) 0.8 μl 200 nM
Bulge-LoopTM Reverse Primer (5 μM) 0.8 μl 200 nM
ddH2O 至20 μl ?

注:1)正反向引物初始反應濃度推薦使用200nM,最佳濃度可以在100nM~500nM之間優化;

2)Bulge-LoopTM Reverse Primer為通用引物,與Bulge-LoopTM RT Primer的特異序列相匹配,與miRNA無關。U6或5S內參需選用各自特異的U6 RT Primer或5S RT Primer。

3)本試劑盒不含ROX染料,使用ABI PRISM? 7000/7700/7900HT,7300/7500/7500 Fast Real-Time PCR System 等需額外添加ROX染料作為校正熒光的儀器,請用戶自行準備所需的ROX染料。

 

2)建議使用標準三步法進行檢測,請在定量PCR儀(以Bio-Rad CFX96為例)上設定如下程序:

循環 步驟 溫度 時間 內容
1X 預變性 95℃ 10 min Taq酶激活
40X 變性 95℃ 2 sec PCR模板變性
退火 60℃ 2 sec 退火
延伸 70℃ 10 sec 延伸

注:部分儀器如ABI系列儀器收集熒光信號需要較長的恒溫時間方能收集信號,使用此類儀器請將反應程序更改為兩步法,將退火及延伸反應合并,時間設置為儀器收集信號所需的最短時間。

 

3)對于用SYBR Green Ⅰ染料法進行的qPCR的檢測反應都需要在循環結束后立即進行融解曲線分析,檢測溫度為70℃~95℃,升溫速率為0.5℃/次,恒溫時間為5 sec/次。

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