Gene ID或轉錄本快速查找方法
如何查找Gene ID?
1、點擊訪問NCBI網站:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/
2、在首頁中下圖的選擇框處選擇“Gene”
3、選取“Gene”后在空白框中輸入基因名稱,或轉錄本號,點擊“Search”,此處以基因GAPDH為例。
4、在搜索結果中找到所需基因ID。注意圖中紅框處的物種信息,依據自己所需要的物種選擇基因。以人源GAPDH基因為例,其基因ID即在箭頭所指處。如果點擊基因名稱,則可看到該基因的位置、轉錄本、參考文獻等眾多其它信息。
如何查找轉錄本號(Transcript ID)?
1.找到你感興趣的Gene ID和物種所對應的一個基因名,點擊這個基因名,打開一個新的頁面;
2.下翻網頁找到NCBI Reference Sequences (RefSeq)區域,mRNA and Protein(s),即可找到該Gene ID下面的一個或多個轉錄本號(Transcript ID),選擇您最終要研究的轉錄本號。
如何查找miRNA Accession?
登錄miBase網站,輸入miRNA名稱,提交即可查找到Accession No.以及是否為成熟體(Mature).

如何查找其他相關基因或RNA的數據庫信息?
更多基因或轉錄本信息,請查詢如下網站。
NCBI數據庫:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/
miRBase(miRNA研究常用數據庫):http://www.mirbase.org/search.shtml
circBase(circRNA研究常用數據庫):http://www.circbase.org/
piRNABank(piRNA研究常用數據庫):http://pirnabank.ibab.ac.in/
NONCODE(lncRNA研究):http://www.microvesicles.org/
lncRNAdb(lncRNA研究數據庫):http://student4.postech.ac.kr/evpedia2_xe/xe/
lncRNA Database(lncRNA研究數據庫):http://www.valadkhanlab.org/database
以上數據庫信息最終解釋權歸該數據庫所有者。

