用于早期發現食管鱗狀細胞癌的基于microRNA的液體活檢標記：一項回顧性、前瞻性和多中心研究
發表期刊：Mol Cancer
影響因子：27.401
發表時間：2022年2月11日
?
背景：目前，尚無臨床相關的無創生物標志物可用食管鱗狀細胞癌（ESCC）早期發現。本研究旨在使用系統的全基因組miRNA表達譜分析，建立并評估了一種基于循環microRNA（miRNA）的標記，用于早期檢測ESCC。
結果：本研究從三個miRNA表達數據集（n=108、238和216）中確定了18個初始候選miRNA，隨后驗證了它們在ESCC組織中的表達。隨后，研究人員在血清樣本中證實了8個miRNA（miR-103、miR-106b、miR-151、miR-17、miR-181a、miR-21、miR-25和miR-93）的過表達。使用血清訓練隊列，研究人員開發了一個循環miRNA標記（AUC: 0.83 [95%CI: 0.79-0.87]），并且在兩個獨立的驗證隊列中證實了miRNA標記的診斷性能（n=126, AUC: 0.80 [95%CI:0.69-0.91]和n=165, AUC:0.89 [95%CI:0.83-0.94]）。最后，在兩個前瞻性隊列（n=185, AUC: 0.92，[95%CI: 0.87-0.96] 和n=188，AUC: 0.93，[95%CI: 0.88-0.97]）中證明了8-miRNA標記的診斷性能。重要的是，8-miRNA標記在區分早期ESCC患者和健康對照方面優于目前的臨床血清學標志物（p<0.001）。
結論：本研究開發了一種新穎且強大的基于循環miRNA的早期檢測ESCC的標記，該標記在多個回顧性和前瞻性跨國、多中心隊列中成功驗證。
Fig1. 隨機前瞻性隊列評估用于檢測ESCC的循環miRNA標記
原文鏈接：https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35148754/
人類microRNA（miR-20b-5p）調節阿爾茨海默病通路和神經元功能，與MIR20B基因接近的特定多態性
影響阿爾茨海默病生物標志物
發表期刊：Molecular Psychiatry
影響因子：15.992
發表時間：2022年1月27日
阿爾茨海默?。ˋD）是一種進行性神經退行性疾病，伴有認知、執行和其他心理功能的喪失，是最常見的與年齡相關的癡呆形式。淀粉樣蛋白-β肽（Aβ）有助于疾病的病因和進展。Aβ來源于淀粉樣蛋白-β前體蛋白（APP）。多種microRNA（miRNA）種類也與AD相關。本研究報道了由X染色體上MIR20B基因產生的人類hsa-miR20b-5p（miR-20b）可能在AD發病機制中發揮了復雜的作用，包括Aβ調節。具體而言，miR-20b-5p miRNA水平的改變與人類大腦三個區域的疾病進展相關：顳葉新皮層、小腦和后扣帶皮層。在培養的人類神經元細胞中，miR-20b-5p處理干擾了鈣穩態、神經突生長和分支點。MIR20B基因（rs13897515）上游的單核苷酸多態性（SNP）與腦脊液（CSF）Aβ1-42水平和內嗅皮質厚度的差異相關。研究人員在APP mRNA 3′-非翻譯區（UTR）中定位了一個miR-20b-5p結合位點，使用miR-20b-5p處理降低了APP mRNA和蛋白質水平。蛋白質-蛋白質相互作用和基因共表達的網絡分析揭示了AD相關蛋白質/基因中其他重要的潛在miR-20b-5p靶標。MiR-20b-5p是一種可下調APP的miRNA，與AD風險增加矛盾相關。然而，miR-20b-5p也減少了，并且siRNA對APP的阻斷同樣減少了鈣內流。由于APP在神經元健康中發揮著至關重要的作用，并且不只是作為“致病性”Aβ的來源而存在，因此AD的分子病因可能不僅僅是一種“過量”的疾病，而是一種微妙的內穩態的破壞。
Fig2. miR-20b依賴于鈣通道活性的潛在機制
原文鏈接：https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35087196/
阻斷miR-143/-145簇介導的促纖維化反應增強了對黑色素瘤靶向治療的反應
發表期刊：EMBO Mol Med
影響因子：12.137
發表時間：2022年2月14日
譜系去分化趨向顯示肌成纖維細胞和纖維化特征的間充質樣狀態是黑色素瘤對靶向治療的適應性和獲得性耐藥的常見機制。本研究發現抗纖維化藥物nintedanib在黑色素瘤的臨床前模型中具有使纖維ECM網絡正?；?、增強MAPK靶向治療的功效，以及延緩腫瘤復發的活性。這種耐藥表型的獲得及其通過nintedanib的逆轉表明，miR-143/-145促纖維化簇是這種間充質樣表型的驅動因素。在體外和體內的黑色素瘤細胞中觀察到在BRAFi/MAPKi治療下miR-143/-145簇的上調，并且與侵襲性/未分化譜相關。由該簇產生的2個成熟miRNAs，miR-143-3p和miR-145-5p，通過靶向FSCN1協作介導向耐藥性未分化間充質樣狀態的轉變，通過調節粘著斑動力學和機械轉導途徑調節肌動蛋白細胞骨架和ECM之間的動態串擾。本研究揭示了一種新型miRNA介導的調節網絡的見解，該網絡有助于非遺傳適應性耐藥，并提供了原理證明，即預防MAPKi誘導的促纖維化間質反應對于接受靶向治療的患者來說是一個可行的治療機會。
Fig3. miR-143/-145簇/FSCN1軸對機械敏感性轉錄共激活因子YAP和MRTF的調節
原文鏈接：https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35156321/
用于miRNA-疾病關聯預測的分層圖注意力網絡
發表期刊：Molecular Therapy
影響因子：11.454
發表時間：2022年2月2日
?
許多生物學研究表明，miRNAs的突變和異常表達可能導致多種疾病。miRNA作為疾病診斷的重要生物標志物，有助于了解疾病的發病機制，促進疾病的鑒定、診斷和治療。然而，miRNAs如何影響這些疾病的致病機制尚未完全清楚。因此，預測潛在的miRNA-疾病關聯對于臨床醫學和藥物研究的發展具有重要意義。本研究提出了一種新型深度學習模型：基于分層圖注意力網絡用于預測miRNA-疾病關聯（HGANMDA）。首先，研究人員基于已知的 miRNA-疾病關聯、miRNA-lncRNA關聯和疾病-lncRNA關聯構建了miRNA-疾病-lncRNA異構圖。其次，應用節點層注意力來學習基于不同元路徑的相鄰節點的重要性。第三，應用語義層注意力來學習不同元路徑的重要性。最后，使用雙線性解碼器來重建miRNA與疾病之間的聯系。大量的實驗結果表明，該模型在預測miRNA-疾病關聯方面取得了良好的性能和令人滿意的結果。
Fig4. 用于miRNA-疾病關聯預測的分層圖注意力網絡模型圖
原文鏈接：https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35121109/
MicroRNA-135通過靶向ZNF217和促進NANOG的m6A修飾來抑制乳腺癌中上皮-間質轉化的啟始
發表期刊：Oncogene
影響因子：9.867
發表時間：2022年2月4日
?
MicroRNAs在各種惡性腫瘤中發揮著重要作用，乳腺癌（BC）也不例外。因此，本研究探討了miR-135在BC進展中的功能機制?？偣矎幕颊吲R床收集了55對BC和匹配的相鄰正常組織，然后對BC組織和細胞中的miR-135和ZNF217（鋅指蛋白217）的表達模式進行了定量分析。因此，在BC組織和細胞中鑒定出高ZNF217表達和低miR-135表達水平。隨后，改變miR-135和ZNF217的表達以評估它們對BC細胞遷移、侵襲和EMT啟動的影響。研究發現，當ZNF217沉默或miR-135升高時，BC細胞惡性行為得到顯著抑制，并在裸鼠體內重現，以作為體內證據。此外，雙熒光素酶報告基因檢測顯示miR-135和ZNF217之間存在直接結合。隨后的免疫共沉淀、甲基化RNA結合蛋白免疫沉淀和光活化核糖核苷增強交聯和免疫沉淀實驗進一步表明ZNF217可以通過甲基轉移酶樣13（METTL3）降低 N6-甲基腺苷水平來上調NANOG。總的來說，本研究結果強調了miR-135/ZNF217/METTL3/NANOG軸在BC進展中的作用，強調了潛在的治療靶點ZNF217沉默和miR-135上調在預防或治療BC中的作用。
Fig5. miR-135/ZNF217/METTL3/NANOG參與BC進展的模型示意圖
原文鏈接：https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35121826/
