Liquid biopsy: Exosomal microRNAs as novel diagnostic and prognostic biomarkers in cancer
液體活檢：外泌體microRNAs作為癌癥的新型診斷和預后生物標志物
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發表期刊：Mol Cancer
影響因子：27.401
發表時間：2022年2月16日
背景：在臨床表現之前及早發現癌癥可能是降低癌癥死亡率的有效策略。因此，鑒定高效的液體活檢生物標志物可能是一種有前途的無創癌癥診斷方法。
正文：液體活檢越來越多地被用作活檢的補充，因為它可以在臨床和影像學確診前幾個月檢測到疾病進展。許多體液含有外泌體microRNAs（miRNAs），由于外泌體中miRNAs的穩定性，可以為早期和微創癌癥診斷提供一類新的生物標志物。在這篇綜述中，作者主要關注外泌體miRNAs（液體活檢）作為各種癌癥診斷和預后的生物標志物。
結論：外泌體miRNAs可用作診斷和預后生物標志物，為各種惡性腫瘤的進展和治療反應提供獨特的見解和更動態的視角。因此，開發利用外泌體miRNAs的新的和更靈敏的技術應該是癌癥管理的優先事項。
Fig1. miRNAs進入外泌體的分選機制
原文鏈接：https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35172817/
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Depth normalization of small RNA sequencing: using data and biology to select a suitable method
小RNA測序的深度歸一化：利用數據和生物學選擇合適的方法
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發表期刊：Nucleic Acids Res
影響因子：16.971
發表時間：2022年2月21日
深度測序已成為生物醫學研究中最流行的轉錄組分析工具之一。雖然存在大量用于“標準化”測序數據的計算方法，以消除由于實驗處理而導致的不必要的樣本間變化，但對于哪種標準化最適合給定數據集，目前尚無共識。為了解決這個問題，本研究開發了“DANA”，一種基于生物學驅動和數據驅動的指標用以評估microRNA測序數據標準化方法性能的方法。該方法利用眾所周知的microRNAs生物學特征，對其表達模式和染色體聚類進行同時評估（i）標準化如何有效地去除處理偽影以及（ii）標準化如何恰當地保留生物信號。通過DANA，本研究確認了八種常用歸一化方法在不同數據集之間的性能差異很大，并為給手頭的數據選擇合適的方法提供了指導。因此，應該將其作為microRNA測序數據分析的常規預處理步驟（歸一化之前）。DANA是在R中實現并可在https://github.com/LXQin/DANA上公開獲得。
Fig2. TCGA-BRCA和TCGA-UCS聯合數據的歸一化評估
原文鏈接：https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35188574/
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EBV miRNAs BART11 and BART17-3p promote immune escape through the enhancer-mediated transcription of PD-L1
EBV miRNAs BART11和BART17-3p通過增強子介導的PD-L1轉錄促進免疫逃逸
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發表期刊：Nat Commun
影響因子：14.913
發表時間：2022年2月14日
據報道，愛潑斯坦-巴爾病毒（EBV）是最早發現的人類腫瘤病毒，與鼻咽癌（NPC）、胃癌（GC）及多種淋巴瘤的發生發展密切相關。PD-L1在EBV陽性NPC和GC組織中表達升高；然而，EBV依賴性促進PD-L1表達以誘導免疫逃逸的具體機制仍有待闡明。EBV編碼44個成熟的miRNAs。本研究發現EBV-miR-BART11和EBV-miR-BART17-3p在EBV相關NPC和GC中上調PD-L1的表達。此外，EBV-miR-BART11靶向FOXP1，EBV-miR-BART17-3p靶向PBRM1，FOXP1和PBRM1與PD-L1的增強子區域結合以抑制其表達。因此，EBV-miR-BART11和EBV-miR-BART17-3p分別抑制FOXP1和PBRM1，并增強PD-L1的轉錄（CD274，http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/29126 )，從而促進腫瘤免疫逃逸，這為EBV相關腫瘤免疫治療的潛在靶點提供了見解。
Fig3. EBV-miR-BART11、EBV-miR-BART17-3p激活PD-L1促進腫瘤免疫逃逸的機制
原文鏈接：https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35165282/
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Brain-Penetration and Neuron-Targeting DNA Nanoflowers Co-Delivering miR-124 and Rutin for Synergistic Therapy of Alzheimer’s Disease
腦穿透和神經元靶向的DNA納米花共同遞送miR-124和蘆丁以協同治療阿爾茨海默病
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發表期刊：Small
影響因子：13.281
發表時間：2022年2月19日
阿爾茨海默?。ˋD）是影響數百萬老年人癡呆癥的主要原因。盡管在對AD病理生物學的理解方面取得了重大進展，但尚無改善疾病的治療方法。MicroRNA-124（miR-124）是正常腦中最豐富的miRNA，具有改善AD樣病理的強大功效，而在AD腦中則是缺失的。本研究開發了一種基于DNA納米花（DFs）的遞送系統，以實現外源性補充miR-124用于AD治療。制備尺寸和形態可控的DFs，并通過雜交連接miR-124嵌合體。用RVG29肽進一步修飾DFs，以同時實現血腦屏障（BBB）穿透和神經元靶向。同時，蘆丁作為一種小分子輔助藥物，通過嵌入雙鏈DNA區域，共同裝載到DFs結構中。有趣的是，蘆丁可以協同miR-124抑制BACE1和APP的表達，從而實現對β淀粉樣蛋白生成的強烈抑制。該納米系統可以延長miR-124在體內的循環，促進其BBB滲透和神經元靶向，導致APP/PS1小鼠海馬中miR-124的顯著增加和體內強大的治療效果。這種生物源性治療系統顯示出作為一種用于AD治療的生物相容性納米藥物的前景。
Fig4. Rutin@DF-miR-124/RVG29（RDMR）納米系統的制備及其在AD治療中的應用示意圖
原文鏈接：https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35182016/
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miR-137 and miR-122, two outer subventricular zone non-coding RNAs, regulate basal progenitor expansion and neuronal differentiation
兩個外腦室下區非編碼RNAs miR-137和miR-122調節基底祖細胞擴張和神經元分化
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發表期刊：Cell Rep
影響因子：9.423
發表時間：2022年2月15日
靈長類動物大腦皮質擴張依賴于生發區在長期發育期間的擴大。盡管大多數哺乳動物有兩個皮質生發區，即腦室區（VZ）和腦室下區（SVZ），但多腦回物種有一個額外的生發區，即外腦室下區（oSVZ），這增加了皮質生成過程中產生的神經元的數量和多樣性。oSVZ如何在進化過程中出現的還尚不清楚，但最近的研究表明非編碼RNAs的作用，允許在發育過程中進行嚴格的遺傳程序調節。本研究使用體內功能遺傳學、單細胞RNA測序、體內成像和電生理學來評估小鼠的祖細胞和神經元特性，鑒定了兩種oSVZ表達的microRNAs（miRNAs），miR-137和miR-122，它們調節皮質擴張的關鍵細胞特征。miR-137促進基底祖細胞自我復制和表層神經元命運，而miR-122降低神經元分化的速度。這些發現支持miRNA介導的基因表達在皮質擴張中的細胞類型特異性作用。
Fig5. miR-137和miR-122調節基底祖細胞擴張和神經元分化的模型示意圖
原文鏈接：https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35172154/
