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A plant immune protein enables broad antitumor response by rescuing microRNA deficiency

一種植物免疫蛋白通過挽救microRNA缺乏可實現廣譜抗腫瘤反應

 

發表期刊:Cell
影響因子:41.582
發表時間:2022年5月26日

 

癌細胞具有不可控細胞周期激活的特點,而microRNA缺乏會驅動腫瘤發生。RNA依賴性RNA聚合酶(RDR)在植物中對小RNA介導的免疫反應至關重要,但在脊椎動物中不存在。本研究發現植物RDR1的異位表達通??梢砸种瓢┘毎鲋?。在許多人類原發性腫瘤中,具有1-nt-shorter 3’末端的異常microRNA亞型被廣泛積累。具有核苷酸轉移酶活性的RDR1可以識別和通過單核苷酸修飾有問題的不含AGO2的microRNA雙鏈體,以恢復其2nt懸垂結構,最終挽救AGO2加載效率并提高全局miRNA表達,以特異性抑制癌細胞周期。RDR1的廣譜抗腫瘤作用可以通過腺相關病毒遞送,在體內多個異種移植腫瘤模型中可見??傊狙芯拷沂玖水惓icroRNA亞型在腫瘤中的廣泛積累,并通過編輯和修復有缺陷的microRNAs開發了植物RDR1介導的抗腫瘤策略。

Fig1. 植物免疫蛋白RDR1通過挽救microRNA缺陷實現廣泛抗腫瘤反應的模型示意圖

 

原文鏈接:https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35623329/

 

 

miR-223 Exerts Translational Control of Proatherogenic Genes in Macrophages

miR-223對巨噬細胞中的促進動脈粥樣硬化基因進行翻譯控制

 

發表期刊:Circulation Research
影響因子:17.367
發表時間:2022年5月25日

 

背景:動脈粥樣硬化疾病的一個重大負擔是由炎癥驅動的。最近,microRNAs(miRNAs)已成為驅動和保護動脈粥樣硬化的重要因素。miR-223通過靶向膽固醇生物合成途徑和NF-kB信號通路調節膽固醇代謝和炎癥;然而,尚未研究其在動脈粥樣硬化中的作用。我們假設miR-223全面調節巨噬細胞中的核心炎癥通路,以響應炎癥和導致動脈粥樣硬化的刺激,從而限制動脈粥樣硬化的進展。

 

方法和結果:巨噬細胞中miR-223的缺失降低了Abca1基因和蛋白質的表達以及膽固醇外流到apoA1(載脂蛋白A1),并增強了促炎基因的表達。相比之下,miR-223過表達促進了膽固醇外流和巨噬細胞極化趨向抗炎表型。miR-223的這些有益作用依賴于其靶基因,轉錄因子Sp3。與miR-223在體外的抗動脈粥樣硬化作用一致,接受miR223-/-骨髓的小鼠表現出斑塊大小、脂質含量和循環炎性細胞因子(即IL-1β)的增加。與對照小鼠相比,骨髓源性細胞中miR-223的缺乏也會導致循環促動脈粥樣硬化細胞(總單核細胞和中性粒細胞)的增加。此外,在缺乏miR-223的小鼠骨髓源性細胞中,主動脈弓中miR-223靶基因(Sp3)和促炎標志物(Il-6)的表達增強,而Abca1和抗炎標志物 (Retnla) 的表達降低。在喂食高膽固醇飲食的小鼠和患有不穩定頸動脈粥樣硬化的人類中,miR-223的表達增加。為了進一步了解miR-223對體內動脈粥樣硬化影響的分子機制,研究人員從接受野生型或miR223-/-骨髓的小鼠中分離巨噬細胞,并分析了巨噬細胞的全局RNA翻譯圖譜。使用核糖體分析,本研究揭示了在翻譯水平上炎癥信號和脂質代謝的顯著上調,但在轉錄水平上則不那么顯著。在翻譯水平上對上調基因的分析揭示了miR-223結合位點的富集,證實了miR-223通過改變其翻譯對致動脈粥樣硬化巨噬細胞中的靶基因產生顯著變化。

 

結論:本研究表明,miR-223可以通過作為膽固醇外流和炎癥通路的RNA翻譯的全局調節因子來預防動脈粥樣硬化。

Fig2. miR-223對巨噬細胞中的促進動脈粥樣硬化基因進行翻譯控制的模型圖

 

原文鏈接:https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35611698/

 

 

enrichMiR predicts functionally relevant microRNAs based on target collections

enrichMiR基于靶標集合來預測功能相關的microRNAs

 

發表期刊:Nucleic Acids Research
影響因子:16.971
發表時間:2022年5月24日

 

MicroRNAs(miRNAs)是一類小的非編碼RNAs,是基因表達的主要轉錄后調節因子之一。大量的數據集合和預測工具已經收集了這些調節因子假定或確認的靶標。對于發現和驗證來說,利用這些集合在給定的轉錄特征或基因集中進行靶標富集分析以預測相關的miRNAs,通常是很有用的。盡管為此提出了幾種方法,但缺乏使用各種方法和集合進行此類分析的靈活且容易使用的界面。enrichMiR(https://ethz-ins.org/enrichMiR/)通過使用戶能夠基于幾個靶標集合執行一系列富集測試來解決這一差距,以根據miRNAs可能參與控制某一給定轉錄特征或基因集的程度對miRNAs進行排序。此外,enrichMiR結果還可以通過交互式和可發布的圖表進行可視化。為了指導選擇適當的分析方法,研究人員在一組涉及已知miRNAs擾動的實驗中對各種測試進行了基準測試。最后,研究人員在兩個用例中展示了enrichMiR的功能。

Fig3. enrichMiR操作流程示意圖

 

原文鏈接:https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35609985/

 

 

MicroRNAs in drug addiction: Current status and future perspectives

MicroRNAs在藥物成癮中的研究現狀與展望

 

發表期刊:Pharmacology & Therapeutics
影響因子:12.310
發表時間:2022年5月21日

 

藥物成癮是一種慢性和復發性腦部疾病,其特征是強迫性藥物尋求和持續使用藥物,盡管有不良后果。成癮的高流行率和社會負擔是無可爭辯的;然而,現有的干預措施是不夠的。在成癮動物模型中,在獎賞相關的大腦區域中觀察到異常基因表達?;虮磉_的調節和神經網絡的異常適應歸因于反復接觸成癮藥物后大腦功能的變化。對microRNA(miRNA)作用的新認識為中樞神經系統中的許多生物學和病理過程提供了新的見解。大量研究表明,miRNAs是藥物成癮中轉錄后基因表達的強調節因子。本文提供了miRNAs的綜述,并提供了miRNA異常表達以及miRNA在藥物成癮和神經適應中的調節作用的證據。通過本文作者提供的觀點可以得出結論,即miRNAs有潛力成為藥物成癮的新治療靶點。

Fig4. miRNA調節藥物成癮中的神經傳遞

 

原文鏈接:https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35609719/

 

 

miR-188-3p targets skeletal endothelium coupling of angiogenesis and osteogenesis during ageing

miR-188-3p靶向衰老過程中血管生成和骨生成的骨骼內皮耦合

 

發表期刊:Cell Death & Disease
影響因子:8.469
發表時間:2022年5月25日

 

H型血管是一種特定的骨毛細血管亞型,具有高表達的CD31和endomucin,最近顯示可耦合血管生成和骨生成。骨組織中H型血管的數量隨著年齡的增長而減少,這種減少的潛在機制尚不清楚。本研究報道了microRNA-188-3p(miR-188-3p)參與這一過程。miRNA-188-3p在骨骼內皮中表達上調,并在衰老過程中負調節H型血管的形成。miR-188缺失的小鼠表現出H型血管與年齡相關的衰退減弱。相比之下,內皮特異性miR-188-3p過表達減少了H型血管的數量,導致骨量減少和骨再生延遲。機制研究發現,miR-188通過直接靶向內皮細胞中的整合素β3來抑制H型血管的形成。本研究結果表明,miR-188-3p是H型血管形成的關鍵調節因子,可能是預防骨丟失和加速骨再生的潛在治療靶點。

Fig5. miR-188-3p通過靶向ITGβ3抑制血管生成

 

原文鏈接:https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35610206/

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