全基因組DNA甲基化測序（Whole Genome Bisulfite Sequencing， WGBS）被視為DNA甲基化研究的“金標準”，結合重亞硫酸鹽（Bisulfite）處理和高通量測序技術，實現全基因組范圍內單個C堿基的甲基化分析，適用于全基因組精細甲基化圖譜的構建。
通過研究DNA甲基化與腫瘤、神經變性疾病和自身免疫性疾病等的相關性，以及胚胎發育、基因印跡和X染色體失活等過程，探討表觀遺傳學研究的重要意義。
服務優勢
● 平臺完整：從樣本處理、建庫、測序到生物信息學分析提供一站式優秀服務
● 精確度高：成熟的甲基化轉化處理技術，精確實現單個C堿基甲基化狀態分析
● 覆蓋范圍廣：可在全基因組水平上實現甲基化位點檢測
● 重復性好：穩定處理，適用于多樣本間的比較分析
項目流程
生物信息學分析項目
| 測序類型 | 基本分析 | 高級分析 |
|---|---|---|
| WGBS測序 （有參考基因組） | 1、 數據質量評估及QC 2、 基因組比對 3、 測序深度及覆蓋度統計 4、 數據的可視化 5、 甲基化檢測質控 6、 甲基化位點檢測及統計 7、 甲基化位點附近序列特征檢測 8、 樣品間相關性分析 9、 PCA分析 10、 差異甲基化位點（DMS）分析 11、 差異甲基化區域（DMR）分析 ????11.1 DMR鑒定結果統計 ????11.2 DMR結構注釋 ????11.3 DMR基因GO富集分析（僅限模式物種） ????11.4 DMR基因KEGG富集分析（僅限模式物種） 12、 差異甲基化啟動子（DMP）分析 ????12.1 差異甲基化啟動子（DMP）統計（僅限模式物種） ????12.2 DMP聚類分析（僅限模式物種） ????12.3 DMP 基因GO富集分析（僅限模式物種） ????12.4 DMP基因KEGG富集分析（僅限模式物種） | 1、 甲基化數據SNP檢測 2、 腫瘤純度分析 3、 甲基化轉錄因子鑒定 4、 與其他測序數據關聯分析 |
常見問題
1. 哪些物種可以開展WGBS研究？
目前主要開展擁有完整基因組序列（拼接到染色體水平）和完整基因注釋文件（包含基因水平，有外顯子、內含子、CDS等）的真核生物，特殊情況建議反饋物種拉丁名進行項目評估。
2. WGBS項目mapping rate相對其他項目低？
WGBS建庫過程中，Bisulfite處理將umC轉化為U，mC維持不變。PCR擴增后，所有mC不受影響，而umC變成T，互補鏈就變成A；初始的雙鏈DNA就變成了四條不同的鏈。采用Bismark軟件與參考基因組進行比對，將所有參考基因組和reads上的C變成T（另一條鏈G變成A），導致mismapping 的堿基位點較多，mapping rate降低。
3.不同甲基化測序方法比較的優缺點？
