外泌體廣泛存在于細胞上清與外周血、尿液、腹水等體液中，可來自各種類型細胞。外泌體的內容物含蛋白質、脂質和核酸等，外泌體的脂膜包裹和保護，使得內容物可以保持其原有穩定性和生物學功能。外泌體RNA特別是非編碼RNA，在不同的疾病模型中存在明顯的表達差異，有望成為液體活檢的重要分子標志物，并揭示疾病發生的機理。利用高通量轉錄組測序技術可以同時檢測其所含RNA分子如lncRNA，mRNA，對外泌體mRNA、lncRNA等的鑒定和調控功能進行研究。
服務優勢
1、專利外泌體抽提技術，配合特有微量RNA建庫方法，提供lncRNA測序整體服務
2、采用3個外泌體或囊泡數據庫，注釋信息更完善，為深入挖掘結果提供佐證
3、多種差異表達計算方法，可根據項目情況靈活選擇算法，展現更完美的數據
4、全新的比對軟件，分析速度更快，結果更準確
5、提供腫瘤研究的臨床數據分析，使得分析結果更加飽滿。
代表性客戶文章
- Wu Q, Wang J, Tan W L W, et al. Extracellular vesicles from human embryonic stem cell-derived cardiovascular progenitor cells promote cardiac infarct healing through reducing cardiomyocyte death and promoting angiogenesis[J]. Cell death & disease, 2020, 11(5): 1-16.
- Guo N, Zhou Q, Huang X, et al. Identification of differentially expressed circulating exosomal lncRNAs in IgA nephropathy patients[J]. BMC immunology, 2020, 21(1): 1-9.
外泌體研究全面技術路線
高通量測序與分析流程
生物信息學分析項目
| 測序類型 | 基本分析 | 高級分析 |
|---|---|---|
| 外泌體lncRNA測序 | 數據質量評估及QC 核糖體RNA去除率計算 參考基因組比對與全基因組reads分布圖譜 基因表達量整體水平 樣品（組）間基因表達差異分析 差異基因KEGG生物通路富集分析 差異基因 Gene Ontology （GO）功能富集分析 轉錄本表達量整體水平 已知mRNA表達量 已知mRNA表達差異分析 已知ncRNA表達量 已知ncRNA表達量差異分析 哺乳動物已知ncRNA保守性分析 · 近緣物種的保守性分析 · Phylop保守性分析 SNP和InDel檢測及注釋 樣品間相關性分析 樣品間主成分分析 時間序列分析（與分析5二選一） 以下限50條序列分析（僅限于人、大鼠、小鼠物種） lncRNA靶基因預測 lncRNA與靶基因互作分析 lncRNA靶基因KEGG生物通路富集分析 lncRNA靶基因Gene Ontology （GO）功能富集分析 | 1、共表達分析（樣品>=10） 2、lncRNA Disease注釋 3、腫瘤藥物注釋 3.1 腫瘤耐藥基因注釋 3.2腫瘤靶向藥物注釋 4、基因融合分析 5、可變剪切分析（rMATs） 6、lncRNA-miRNA互作分析 7、基因富集分析（GSEA） （每組至少3個生物學重復樣品） 8、加權基因共表達網絡分析 （WGCNA）（加權基因共 表達網絡分析，樣品>=10） 9、RNA結合蛋白預測 10、已知lncRNA甲基化注釋 11、eRNA分析 12、外泌體特有基因注釋 |
常見問題
1.銳博生物提供exosomes中lncRNA測序和分析的同時，是否提供exosomes提取服務，對樣品有何要求？
利用自主研發的RiboTM Exosome Isolation Reagent提取試劑盒，銳博可提供人、大小鼠細胞上清、血清、血漿及其他體液的exosomes提取服務，通過大量實驗驗證，使用RiboTM Exosome Isolation Reagent可高效提取結構和功能完整的exosomes，產物可用于NGS、細胞共培養以及體內注射等后續功能實驗。
2.細胞培養狀態是否會影響外泌體的測序分析結果？
會，不同培養條件的細胞分泌的外泌體量不同；在細胞凋亡的過程中，會釋放大量的凋亡小體和細胞碎片，凋亡小體也是囊泡狀結構，在外泌體分離時難以排除凋亡小體，從而影響測序數據。
3.送樣要求有哪些要求？
