外泌體Exosomes來源于晚期核內體(也成為多囊泡體)的囊泡,幾乎所有類型的細胞都能分泌外泌體,且廣泛分布于血清、血漿、尿液、腹水和細胞上清等樣品中。Exosomes內包含蛋白質、RNA和脂類,可參與調控重要的細胞生理活動,在免疫應答、凋亡、血管生成、炎癥反應和凝結等過程中均有報道,成為多種疾病治療的潛在靶點、早期診斷標記物、靶向藥物載體等,是近年來生命科學及醫學領域的重要研究熱點。
服務優勢
2、采用3個外泌體或囊泡數據庫,注釋信息更完善,為深入挖掘結果提供佐證
3、提供腫瘤研究的臨床數據分析,使得分析結果更加飽滿
4、4個最新數據庫預測靶基因,結果更準確
外泌體中miRNA常見功能
Small RNA主要包含miRNA、piRNA、tsRNA和snoRNA等RNA分子。小RNA參與基因表達與調控、RNA的加工與剪切、蛋白質翻譯、遺傳“入侵”抑制、配子發生等重要生物學過程,是生命活動中不可少的調控因子。微小RNA(microRNA,簡稱miRNA)是小RNA的最主要部分,已被證明與包括癌癥、心血管疾病、免疫系統疾病在內的多種疾病密切相關。如:miRNA可以被外泌體運輸到其他細胞組織,為癌細胞轉移創造合適的微環境,從而促進癌細胞轉移。此外,外泌體miRNA也可以作為疾病的生物標志物,廣泛應用于疾病診斷、個性化治療和預后等領域。高通量測序技術可以在單次測序中獲得樣品中所有小RNA的序列信息,從而分析不同疾病狀態、不同樣品來源、不同處理條件下小RNA的表達水平,并精確比較其之間的小RNA表達差異,從而為后續研究小RNA的生物學意義提供指引。
外泌體研究全面技術路線
高通量測序與分析流程
生物信息學分析項目
| 測序類型 | 基本分析 | 高級分析 |
|---|---|---|
| 外泌體小RNA測序 | 1、 數據質量評估及QC 2、 序列比對 3、 全基因組Reads分布圖譜 4、 ncRNA分類與注釋 5、 已知miRNA分析 ????5.1 已知miRNA表達量 ????5.2 已知miRNA整體表達量分析 ????5.3已知miRNA長度 ????5.4 已知miRNA堿基偏好性分析 6、 基因組重復區域注釋 7、 功能元件注釋 8、 新miRNA預測 9、 共有及特有序列分析 10、 樣品間miRNA表達差異分析 11、 miRNA家族分析(僅限于模式物種) 12、 miRNA保守性分析(僅限于模式物種) 13、 miRNA堿基編輯分析 14、 樣品間相關性分析 15、 樣品間主成份分析 16、 差異表達miRNA靶基因預測(已知miRNA,僅限于人/大鼠/小鼠三個物種) ????16.1 miRNA基本信息 ????16.2 靶基因預測方法介紹 ????16.3 靶基因預測結果 ????16.4 候選靶基因 17、 差異表達miRNA靶基因的KEGG通路富集分析 18、 差異表達miRNA靶基因的GO功能富集分析 | 1、 miRNA靶基因預測(非模式物種或新miRNA) 2、 新miRNA差異表達分析 3、 miRNA疾病數據庫注釋(僅限于人) 4、 外泌體數據庫注釋(僅限于人/大鼠/小鼠三個物種) tsRNA分析 1、 tsRNA來源分析 2、 tsRNA表達量分析 3、 ts差異分析 4、 tsRNA表達聚類分析 |
常見問題
1.沒有參考基因組的物種,或miRBase沒有參考物種的miRNA序列,可以做外泌體Small RNA測序嗎?
無參考基因組的物種可以先做無參轉錄組拼接轉錄本,以轉錄本作為參考序列用于Small RNA測序分析,或用近緣物種的基因組作為參考;miRBase沒有收錄待研究物種的miRNA序列,可用近緣物種的miRNA序列進行注釋。
2. 外泌體收樣有哪些注意事項?
分離exosomes前的樣品不能加入任何RNA保護劑(如TRIzol,RNAlater)。
血清樣品采血后,輕輕將全血滴入潔凈的EP管或者離心管;4℃下靜置3~4小時,可見血塊析出;再進行離心。血漿樣品不能用肝素抗凝,用采血針和EDTA抗凝管抽取全血混勻;4℃下靜置3~4小時,再離心取上清。細胞上清樣品在細胞培養環節需采用去除exosomes的血清,且避免支原體污染。更詳細的樣品收集步驟請參考《收樣流程》。
3.送樣有哪些要求?


