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高內涵篩選加速腫瘤靶標功能發現就是這么回事!

高內涵分析與篩選(HCA&HCS)已經越來越多的應用于探索癌癥機理和腫瘤治療研究中,相比傳統的生物學功能與機制研究手段,HCA&HCS在發現新的靶點、功能及機制方面,能夠更深入探索復雜細胞學機理及互作,進行基于非破壞性細胞或模式生物的多標記/多靶點/多參數的研究并實現高通量快速大規模分析,從單個細胞至細胞群組,實驗時間從幾個月、數天縮短至幾個小時或幾分鐘,還能獲得完美細胞影像與精準定量化信息,讓科學家提出更突破性的細胞學問題,發掘更高價值的研究成果。HCA&HCS實驗在發現新的靶點、研發靶向藥物或篩選全新的分子方面正發揮著越來越重要的作用。

今天,小編跟大家分享一篇高內涵和基因文庫應用于腫瘤轉移潛在靶標發現和篩選的好文章,小伙伴們趕快搬好小板凳,干貨滿滿哦。

這篇題為“miR-20a triggers metastasis of gallbladder carcinoma”發表在Journal of Hepatology(IF:12.486)期刊并來自上海交通大學王紅陽教授課題組,先來學習一下研究策略。

研究路線

miRNAs的功能失調已被證實參與了各種腫瘤的發展。然而,miRNA是否參與膽囊癌(GBC)的轉移和進展尚不清楚。研究人員通過高內涵篩選(HCS)及micrONTM miRNA mimic Library(銳博生物提供)鑒定了一個可促進GBC轉移的miR-20a,并進一步揭示TGF-β1介導的miR-20a/Smad7/β-catenin軸的激活對于GBC的發病機制及不良預后具有關鍵作用,并且可能作為未來潛在的治療靶標。

主要研究結果

1) 高內涵miRNA文庫篩選鑒定轉移相關的miRNAs

為了鑒定控制GBC細胞轉移的新型miRNAs,開發了基于HCS的功能獲得性方法。在880個miRNAs mimic文庫(銳博生物提供),僅篩選出24個miRNAs作為促轉移因子。通過顯微鏡檢查(細胞融合度>80%或<30%)驗證后確定了17個miRNAs。隨后,檢測了前10個miRNAs的表達,并發現在GBC腫瘤及正常膽囊組織中均可檢測到miR-20a和miR-1470,但僅有miR-20a在腫瘤組織中高表達。與TGF-β1相比,miR-20a顯著增加了F-actin微絲的長度和厚度。

2) miR-20a在GBC轉移和生長中起著關鍵作用

接著,為了全面了解CASC9功能的分子機制,研究人員進行Microarray分析與機制實驗發現CASC9優先影響與ECM-整合素相互作用相關的基因表達(fig3f),其中包括整合素通路上游誘導物LAMC2。并且證明了LAMC2在ESCC組織中也上調,可促進ESCC轉移(fig3CE),LAMC2過表達可增強細胞的遷移和侵襲(fig4B),表明LAMC2在協調ESCC轉移過程中起到與CASC9相似的作用。挽救實驗顯示LAMC2過表達部分損害了CASC9敲降導致的細胞遷移和侵襲能力的下降(fig4C)。表明LAMC2是CASC9誘導的轉移活性的主要下游介質。

體外實驗發現外源性miR-20a mimics處理的GBC-SD細胞表現出細胞間接觸減少和更長的形態學形狀;miR-20a antagomir處理導致形成清晰的紡錘形和多角度細胞粘附。此外,在miR-20a存在的情況下,GBC-SD細胞的遷移和侵襲活性增強,但在miR-20a antagomir處理后顯著降低,提示miR-20a可以顯著促進體外GBC細胞的轉移。另外,miR-20a可顯著增加EMT相關基因(N-cadherin、Vimentin和Snail)的表達,同時降低E-cadherin表達。

體內實驗顯示,注射miR-20a antagomir可顯著抑制裸鼠的腫瘤生長。IHC染色顯示在miR-20a antagomir注射的腫瘤組織中E-cadherin為膜定位,Vimentin表達較低和Ki-67陽性細胞較少。隨后構建肝臟腫瘤轉移模型,發現與miR-20a antagomir處理的小鼠相比,對照小鼠的總轉移發生數極高。IHC進一步證實存在腫瘤轉移。

結果表明miR-20a在體外和體內均具有促進細胞增殖和轉移的潛在作用。

3) Smad7是miR-20a的直接靶標

為了弄清楚miR-20a誘導GBC增殖和遷移/侵襲的機制,鑒定了miR-20a潛在的靶基因。發現Smad7含有與miR-20a互補的保守3’UTR元件。熒光素酶報告基因實驗顯示miR-20a可以抑制pGLO-Smad7-WT質粒而不是pGLO-Smad7-MT的報告基因活性。此外,miR-20a antagomir或miR-20a mimics處理GBC細胞導致Smad7 mRNA水平顯著增加或降低。在臨床GBC樣本中也觀察到miR-20a和Smad7之間負相關。

結果表明miR-20a在體外和體內均具有促進細胞增殖和轉移的潛在作用。

4) miR-20a對Smad7表達的負調控對miR-20a促進GBC細胞轉移和上皮-間質轉化至關重要

Smad7是否負責miR-20a介導的GBC-SD細胞的惡性表型?為了解決這個問題,在存在或不存在Smad7表達的情況下檢測了miR-20a對細胞增殖、遷移和侵襲的影響。發現外源性Smad7的表達阻斷了大部分miR-20a誘導的遷移/侵襲和增殖。Western blot分析證明Smad7可以逆轉由miR-20a促進的E-cadherin下調和Vimentin上調。表明Smad7負調控GBC細胞轉移和EMT表型,這對GBC發病過程中miR-20a的促轉移能力是必需的。

5) 減少Smad7導致β-catenin信號的核轉位和反式激活

Smad7是否通過螯合β-catenin的核轉位來抑制miR-20a活性?通過雙報告基因系統、免疫熒光實驗和Western blot發現miR-20a表達的GBC-SD細胞系中β-catenin更多位于核中,且β-catenin信號活性顯著增加;但Smad7過表達可消除miR-20a誘導的β-catenin核積累,并消除了miR-20a增強的β-catenin報告基因活性。表明β-catenin的核質轉位是miR-20a/Smad-7軸操縱GBC細胞轉移的原因。

6) miR-20a表達升高與GBC的不良預后相關

臨床研究發現miR-20a高表達的患者表現出更差的OS,GBCs中Smad7的減少也預示預后不良。此外,miR-20a升高和Smad7水平降低的患者預后甚至更差,表明兩種因素的組合提供了更高的預后準確性。此外,單因素/多因素Cox回歸分析證實miR-20a和Smad7是總生存期的獨立指示因子。進一步表明了miR-20a/Smad7/β-catenin軸在GBC的發展中起關鍵作用,其活性可作為臨床上GBC復發和預后不良的預測標記。

7) miR-20a表達升高對于TGF-β1誘導的細胞轉移是必需的

TGF-β1作為癌癥中炎癥和轉移相關的最有效細胞因子之一,其是否參與GBC的發病機制和miR-20a誘導的腫瘤轉移?ELISA實驗及IHC發現GBC患者血清或腫瘤組織中的TGF-β1顯著增加。有趣的是,在大多數腫瘤組織中TGF-β1的表達與miR-20a正相關,TGF-β1處理GBC細胞后導致miR-20a水平增加;miR-20a antagomir處理GBC細胞則減弱了TGF-β1增強的細胞遷移和侵襲。

本研究表明miR-20a/Smad7/β-catenin軸在TGF-β1誘導的腫瘤轉移中起著關鍵作用,其為膽囊癌提供了潛在的預后標志物和有價值的治療靶標。

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