Annu Rev Pathol丨長鏈非編碼RNAs與人類肝病
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IF：23.474? 2021年8月20日
長鏈非編碼RNAs（lncRNAs）在基因組中廣泛轉錄，表現出多種生物學功能，并通過多種機制發揮作用。人類基因組中lncRNAs的絕對數量引發了關于它們在人類健康和疾病中的潛在生物學意義和作用的重要問題。技術和計算的進步使大量lncRNAs的功能注釋成為可能。盡管近年來與lncRNAs相關的文章數量不斷增加，但涉及肝臟生理學和病理學的文章相對較少。本文概述了lncRNA分類系統和特征的不斷發展，并強調了我們在理解lncRNA對肝病的貢獻方面取得的重要進展，重點是非酒精性脂肪性肝炎、肝細胞癌和膽汁淤積性肝病。
原文鏈接：https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34416820/
J Immunother Cancer丨LINC01140通過充當多個microRNAs海綿促進肺癌進展和腫瘤免疫逃逸
IF：13.751? 2021年8月26日
背景：長基因間非蛋白編碼RNA 1140（LINC01140）是一種長鏈非編碼RNA，在多種癌癥中高表達；然而，其在肺癌（LC）進展和免疫逃逸中的生物學功能仍不清楚。
結果：研究發現LINC01140在人LC組織和細胞系中高表達。高LINC01140水平與LC患者的不良生存相關。LINC01140上調可通過與miR-33a-5p和miR-33b-5p的直接相互作用促進LC細胞的增殖、遷移和侵襲，從而促進c-Myc表達并抑制順鉑誘導的細胞凋亡。在皮下腫瘤異種移植小鼠中，LINC01140敲低顯著降低了腫瘤生長和肺轉移。此外，LINC01140直接抑制miR-377-3p和miR-155-5p的表達水平，導致其共同下游靶標PD-L1的上調，PD-L1是LC免疫治療的關鍵靶標。值得注意的是，本研究證明了LINC01140敲低以及CIK給藥通過降低嚴重聯合免疫缺陷小鼠的PD-L1表達來抑制皮下LC異種移植物的生長。
結論：總的來說，LINC01140過表達可以保護c-Myc和PD-L1 mRNA免受miRNA介導的抑制，并有助于LC細胞的增殖、遷移、侵襲和免疫逃逸。這些結果為LINC01140是一種有前景的LC治療靶點提供了理論基礎。
Fig2. 長基因間非蛋白質編碼RNA 1140（LINC01140）調節肺癌（LC）進展和免疫逃逸模型圖
原文鏈接：https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34446576/
Genome Biol丨染色質lncRNA Platr10通過協調染色體內調控網絡來控制干細胞多能性
IF：13.583? 2021年8月19日
背景：將體細胞重編程為多能性需要核心干細胞因子基因的特定3維染色體內結構。由于對調控這種結構重構的表觀遺傳readers知之甚少，本研究使用了一種新的染色質RNA原位逆轉錄測序（CRIST-seq）方法來分析Oct4啟動子中的長非編碼RNAs（lncRNAs）。
結果：本研究將Platr10鑒定為Oct4-Sox2結合的lncRNA，其在體細胞重編程中被激活。Platr10對于多能性的維持至關重要，缺乏這個lncRNA會導致干細胞退出多能性。在成纖維細胞中，異位表達的Platr10反式激活核心干細胞因子基因并增強多能重編程功能。使用RAT-seq（RNA reverse transcription-associated trap sequencing）發現Platr10與多個多能性相關基因相互作用，包括Oct4、Sox2、Klf4和c-Myc，這些基因已被廣泛用于體細胞重編程。從機制上講，研究人員證明了Platr10有助于協調染色體內啟動子-增強子環并募集TET1（這是一種主動誘導DNA去甲基化以啟動多能性的酶）。進一步的研究表明Platr10包含一個與Oct4啟動子相互作用的Oct4結合元件和一個募集TET1的TET1結合元件。這兩個元件中任何一個突變都會消除Platr10的活性。
結論：這些數據表明Platr10作為一種新型染色質RNA分子，通過調節染色質結構和調節核心干細胞因子網絡中的DNA甲基化來控制反式多能性。
Fig3. Platr10維持多能性的假定模型
原文鏈接：https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34412677/
Clin Transl Med丨含lncRNA MIAT的血清細胞外囊泡通過阻斷miR-485-5p介導的CXCL10抑制誘導心房纖維化、炎癥和氧化應激，從而促進心房重構和心房顫動
IF：11.493? 2021年8月30日
背景：心房顫動（AF）是一種損害心臟功能的室上性心律失常，是發病率和死亡率的主要來源。血清來源的細胞外囊泡（EVs）已被鑒定為攜帶有可用于AF的診斷和治療的潛在生物標志物或靶點。本研究旨在剖析血清來源的EVs中富集的lncRNA MIAT在AF中的作用。
結果：AF患者血清樣本EVs中的MIAT表達上調。進一步分析表明，富含MIAT的血清來源的EVs促進了心房纖維化、炎癥和氧化應激，并加劇了心房重構和由此產生的AF。從機制上講，MIAT與miR-485-5p結合并減弱了其對靶標CXCL10的抑制作用，CXCL10負責含MIAT的血清源性EV在體內細胞纖維化、氧化應激和炎癥以及心房重構中的作用。
結論：總之，含MIAT的血清來源的EV通過消除miR-485-5p介導的CXCL10抑制促進心房重構并加劇AF。這一發現有助于更深入地了解AF的病理生理學。
Fig4. 血清來源的EVs通過MIST/miR-485-5p/CXCL10軸影響AF的機制示意圖
原文鏈接：https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34459123/
Cardiovasc Res丨保守的長鏈非編碼RNA CARMA調節心肌細胞分化
IF：10.782? 2021年8月30日
目的：從多能干細胞生產功能性心肌細胞需要嚴格控制分化過程。長鏈非編碼RNAs（lncRNAs）在細胞發育過程中發揮關鍵調控功能。本研究設計了一種綜合方法來鑒定在分化人類胚胎干細胞（ESCs）中涉及心臟發生的lncRNAs。
方法和結果：本研究鑒定了CARMA（心肌細胞成熟相關的lncRNA），這是一種在人類ESCs中控制心肌細胞分化和成熟的保守lncRNA。CARMA位于MIR-1-1HG附近，MIR-1-1HG是兩種心源性miRNAs：MIR1-1和MIR-133a2的宿主基因，并以反義方向轉錄。CARMA和miRNAs的表達呈負相關，CARMA敲低會增加MIR1-1和MIR-133a2的表達。此外，CARMA具有MIR-133a2的結合位點，表明lncRNA也可能是miRNA作用的靶點。在CARMA下調后，MIR-133a2靶蛋白編碼基因被協同下調。其中，研究人員發現了編碼NOTCH通路效應子的RBPJ基因。NOTCH已被證明可以控制中胚層和神經外胚層譜系之間的二元細胞命運決定，并且NOTCH抑制可導致增強的心肌細胞分化，但神經外胚層衍生物則會受損。有趣的是，在ESCs中發現兩種lncRNAs（linc1230和linc1335），它們是已知的神經外胚層特異性抑制因子，并在Notch1沉默時被上調。linc1230或linc1335的強制表達改善了ESC衍生的心肌細胞的產生。在ESC中的CARMA敲低后，這兩種lncRNAs也被發現上調。
結論：總而言之，這些數據表明存在一個網絡，涉及三個新發現的lncRNAs，兩個myomirs MIR1-1和MIR-133a2以及NOTCH信號通路，用于協調調節ESCs中的心源性分化。
Fig5. CARMA調控心肌細胞分化模型圖
原文鏈接：https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34459880/
